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Exploration of the biosynthetic potential of the secondary metabolome of the newly identified fungal endophyte Cyanodermella asteris

Descripción del proyecto

Biosíntesis innovadora a través del metaboloma secundario del hongo endofito «Cyanodermella asteris»

El hongo endofito «Cyanodermella asteris», recientemente identificado, produce fitoquímicos terapéuticos a través de una vía biosintética no ribosómica durante la simbiosis con las plantas aster. La producción de fitoquímicos durante las interacciones simbióticas está poco estudiada, pero podría representar una solución biotecnológica rentable. El equipo del proyecto CyanoAsterisMETAB, financiado por las Acciones Marie Skłodowska-Curie, se propone investigar el metaboloma secundario de «C. asteris». Para ello, se seleccionaron grupos de genes de policétidos sintasa predichos «in silico» para la construcción de vectores en «Escherichia coli» y la expresión heteróloga en los huéspedes fúngicos «Aspergillus niger» o «Aspergillus nidulans». Las cepas de expresión diseñadas se examinarán en un estudio exhaustivo, mediante la aplicación de espectrometría de masas y resonancia magnética nuclear para identificar los compuestos producidos y las vías biosintéticas pertinentes.

Objetivo

In the proposed research I aim to explore the secondary metabolome of the newly identified fungal endophyte Cyanodermella asteris. In this regard, we have selected two in silico-predicted polyketide synthase gene clusters, which will be further examined. The selected gene clusters thereof are chosen for vector construction in Escherichia coli and subsequently the heterologous expression in fungal hosts (Aspergillus niger or Aspergillus nidulans) will be performed. Afterwards, the engineered expression strains will be examined in a combined effort applying mass spectrometry and nuclear magnetic resonance experiments to identify the newly produced compounds. Additional metabolomics-based tools and molecular networking will be employed. Moreover, the biosynthetic pathways of the isolated natural products of the respective gene clusters will be fully delineated.

Coordinador

TECHNISCHE UNIVERSITAET DRESDEN
Aportación neta de la UEn
€ 173 847,36
Dirección
HELMHOLTZSTRASSE 10
01069 Dresden
Alemania

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Región
Sachsen Dresden Dresden, Kreisfreie Stadt
Tipo de actividad
Higher or Secondary Education Establishments
Enlaces
Coste total
Sin datos