Description du projet
L’architecture chromosomique émerge dans la variation de la population
Le brin d’ADN de chaque cellule eurkaryote, une fois démêlé, mesure 2 m de long. Repliée avec précision dans le noyau, sa configuration 3D est cruciale pour maintenir une transcription correcte des gènes. Pour déterminer l’effet de la variation 1D sur la variation 3D du génome, le projet POPARCH, financé par l’UE, a rassemblé une cohorte unique de 100 poulets élevés dans un environnement contrôlé, ce qui constitue la plus grande étude animale in vivo à ce jour. Les chercheurs élaboreront un catalogue de variantes de séquences d’ADN afin de déterminer comment les variantes d’ADN non codant peuvent contrôler la structure génomique 3D. Cette étude promet d’être un modèle unique pour d’autres études, notamment pour tester de nouvelles thérapies médicamenteuses sur des humains sans interférence d’autres variables.
Objectif
The linear one-dimensional (1D) DNA fiber inside each Eukaryotic cell nucleus folds into a precise three-dimensional (3D) structure, whose structural preservation is vital for correct cell homeostasis and gene-regulatory mechanisms. Previous studies showed that if 3D structure is altered, aberrant phenotypes and diseases can arise. However, little is known on how 1D variation can affect 3D genome variation. Although recently developed technologies allow researchers to generate data to characterize the 3D structural patterns, as of yet no studies have systematically examined how this affects inter-individual 3D variation. I hypothesize a substantial fraction of 3D genome structural variation is controlled through 1D variation, affecting gene expression, and lastly phenotypes. I will test this by quantifying 1D and 3D genomic variation from 100 individuals selected from a chicken cohort my host raised under extremely well-controlled environmental conditions, making it the largest study of its kind up to today, and the first to use an in vivo animal model. Then, computationally I will develop an analytical framework and produce a catalog of DNA sequence variants that condition 3D genome structure. Upon executing my research, I expect to provide a new explanation on how non-coding DNA variants can exert their effect, thus offer new testable hypotheses to researchers interested in genotype-phenotype transitions. This is a proof-of-concept project and, should I be correct, will open a door to expansion in other species, including humans, with a large potential use in medical genomics, thus facilitating pharmacological interventions by disentangling causal intermediate processes. By combining my 3D genomics expertise with the host’s population-statistical genomics knowledge, on his unparalleled cohort of chickens, I will develop unique expertise to place me as the pioneer of a completely new, multidisciplinary field.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- ingénierie et technologie ingénierie des materiaux fibres
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences biologiques génétique chromosome
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale physiologie homéostasie
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2021-PF-01
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
1165 KOBENHAVN
Danemark
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.