Obiettivo
Promoters and enhancers regulate transcription in higher eukaryotes. The classical definition of enhancers is the property to activate gene expression distally, while promoters induce local gene expression. However, itPromoters and enhancers regulate transcription in higher eukaryotes. The classical definition of enhancers is the property to activate gene expression distally, while promoters induce local gene expression. However, it was demonstrated that a subset of promoters, termed Epromoters, also work as bona fide enhancers and regulate distal gene expression. Moreover, it was shown that human single nucleotide polymorphisms (SNP) within Epromoters can influence their function, and consequently distal and proximal gene expression of their target genes. We hypothesise that Epromoters might have an unanticipated key role in coordinating gene expression in disease as well.
In this project, I will develop a dual reporter assay to investigate the enhancer versus promoter function of candidate regions, in order to identify novel Epromoters. Subsequently, selecting candidate Epromoters predicted by a previously developed bioinformatics pipeline, I will use the reporter assay to test the candidates in a high-throughput manner. Moreover, I will select those validated Epromoters that contain human disease associated SNPs using genome-wide association studies databases. Next, to determine which of these disease-associated SNPs have an impact on gene expression through Epromoter function, distally regulated genes will be inferred by genome editing of the identified SNPs in relevant cell lines.
Concluding, I will study the biology of Epromoters by i) analysing their function in physiological context, ii) assessing the impact of overlapping genetic variants, and iii) determining the effect of disease-associated SNPs on Epromoters and their target gene expression, thus providing a valuable resource to understand Epromoters and their potential involvement in different diseases.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2021-PF-01
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
75654 Paris
Francia
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.