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Does hybridization facilitate explosive speciation of Lake Baikal amphipods?

Descrizione del progetto

Un’indagine genomica sugli anfipodi del lago Bajkal

Con oltre 340 specie, gli anfipodi del lago Bajkal costituiscono fino al 20 % degli anfipodi di acqua dolce a livello globale e rappresentano uno dei più grandi gruppi di specie. Nonostante questo status iconico, la loro radiazione adattativa non è ancora stata oggetto di indagini genomiche dettagliate. È proprio questo l’obiettivo del progetto HybridSpecLBA, finanziato dall’UE. Il progetto, che ha già dimostrato quantità eccessive di adattamento parallelo tra i trascrittomi della specie di tale radiazione adattativa, si avvarrà di approcci genomici per verificare se i risultati ottenuti in precedenza possano essere spiegati attraverso l’ibridazione e l’introgressione adattativa. Lo studio dispone del rivoluzionario potenziale di fornire una verifica diretta rispetto a un eventuale ruolo catalizzatore dell’ibridazione nella speciazione rapida in questo sistema.

Obiettivo

"The adaptive radiation of amphipods in Lake Baikal has brought forward more than 340 species (20% of the world’s freshwater amphipods), making it one of the largest species flocks after the famous African cichlid radiations, and one of the only large radiations in temperate climates. Despite this iconic status the radiation has not yet been subject to detailed genomic investigation. During my PhD I was able to demonstrate excessive amounts of parallel adaptation among the transcriptomes of species of this adaptive radiation. In this project, I will use genomic approaches to test whether the previous results could be explained by hybridisation and adaptive introgression. These processes have been shown to occur in other adaptive radiations, but their functional role in rapid diversification is still debated. My preliminary results indicate that hybridization between two independent lineages of Baikalian amphipods emerged in the period when fast speciation started. Furthermore, I found intriguing signals of positive selection on introgressed loci.

Additional data and specific methodology developed in this project will enable me to disentangle the processes governing speciation in this group. Profiting from strong relevant experience of the host laboratory I will re-analyze available transcriptomic datasets together with newly sequenced genomes. I will map precise directions of hybridization at the phylogenetic tree, describe functional associations of introgressed loci, test selection signatures associated with introgression, and estimate the extent to which repeatable ecomorphological traits are underpinned by ""reusable"" elements of ancestral genomes. This research has groundbreaking potential in providing a direct test of a potential catalysing role of hybridization in fast speciation in this system.

"

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2021-PF-01

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

UNIVERSITEIT ANTWERPEN
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 175 920,00
Indirizzo
PRINSSTRAAT 13
2000 Antwerpen
Belgio

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Regione
Vlaams Gewest Prov. Antwerpen Arr. Antwerpen
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

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