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The plant hologenome – is plant adaptative potential shaped by its microbionts?

Descrizione del progetto

Gettare luce sui microbiomi delle piante nella determinazione del successo adattivo ed evolutivo

Nella biologia evolutiva, la diffusione, l’adattamento e la sopravvivenza delle specie rappresentano un’importante tematica. A tal proposito, specie diverse dispongono di capacità diverse e per scoprire perché, gli scienziati si rivolgono ai microbi. Secondo la teoria dell’olobionte, una pianta o un animale non possono essere considerati come un singolo organismo, ma come un olobionte composto dall’ospite e dalla somma di tutti i suoi microbionti. Inoltre, i cambiamenti genomici adattivi nell’olobionte prevedono anche variazioni all’interno della sua comunità microbiontica. Con il sostegno delle azioni Marie Skłodowska-Curie, il progetto PLANTHOLOGENOME determinerà l’associazione tra i genomi delle piante selvatiche, le loro comunità microbiontiche e l’uso del loro habitatavvalendosi delle orchidee e dei relativi microbiomi associati come sistema modello.

Obiettivo

Explaining why related species have very different abilities to spread, adapt and survive is a central question in evolutionary biology. Microbes have long been recognized as key to the ability of plants or animals to explore resources in their environment, and there is now growing recognition that microbionts should be considered an integral part of their host. The holobiont theory state that a plant or animal cannot be considered as an individual organism, but as a holobiont consisting of the host and the sum of all its microbionts, and that adaptive genomic changes in the holobiont also includes changes in its microbiont community. The range of microbionts a species is able to associate with through time and space has been suggested to be correlated to host adaptability to different environments and could thus be an important component in distribution patterns in plants. In this project, I aim to establish the association between wild plant genomes, their microbiont communities and their habitat use, using orchids and their associated microbiomes as a model system. I will generate bacterial and fungal metagenomic profiles from tissue samples from orchids and couple it with host genomic variation to i) Explore the link between individual plant genotype and microbiont community profile using individual level sampling from two closely related orchid species, ii) Measure differences in range and variability of microbiont community among 20 congeneric wild orchid species, and iii) Correlate species-level diversity and variability of microbiont community with distribution range and habitat diversity in 20 congeneric orchid species. The results will impact our general understanding of the importance of plant microbiomes in determining their adaptive and evolutionary success, and provide important knowledge on factors effecting plant distribution of high relevance in nature management and conservation of threatened plant species.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

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Meccanismo di finanziamento

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF -

Coordinatore

KOBENHAVNS UNIVERSITET
Contributo netto dell'UE
€ 230 774,40
Indirizzo
NORREGADE 10
1165 Kobenhavn
Danimarca

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Regione
Danmark Hovedstaden Byen København
Tipo di attività
Istituti di istruzione secondaria o superiore
Collegamenti
Costo totale
Nessun dato