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Using genomics to understand how freshwater fishes turned a lethal environment into an ideal habitat

Descripción del proyecto

Secuenciación profunda del agua salobre

¿Qué relación tienen el genoma de dos especies de peces de agua dulce con el cambio climático? El aumento del nivel del mar y los cambios en las precipitaciones, ambos efectos del actual calentamiento global, alteran drásticamente los ecosistemas de los estuarios. Por lo tanto, entender cómo los cambios ambientales del pasado condujeron a adaptaciones genómicas es la clave para predecir el potencial adaptativo de los peces. El equipo del proyecto BrackAdapt, financiado con fondos europeos, estudia dos especies de peces de agua dulce del mar Báltico, la perca («Perca fluviatilis») y el lucio («Esox lucius»), que desarrollaron ecotipos de agua salobre para prosperar en salinidades superiores a su salinidad interna. Mediante la secuenciación profunda de la perca y el lucio, el equipo de BrackAdapt pretende identificar la historia demográfica y evolutiva de cada especie. La labor del proyecto podría proteger la biodiversidad adaptada localmente.

Objetivo

Ongoing climate change leads to rising sea levels and changes in local precipitation volume and regularity which will reshape estuarine ecosystems across Earth. As current climate change dramatically alters estuarine ecosystems, fish populations must adapt to the novel environment, or they will go extinct. Understanding how past environmental changes led to genomic adaptations is the key to predicting the adaptive potential of fishes facing ongoing climate change and could be the difference between protecting and losing locally adapted biodiversity. Perch (Perca fluviatilis) and pike (Esox lucius) are two freshwater fish species inhabiting freshwater ecosystems across the northern hemisphere. Nevertheless, in the Baltic Sea, which is the worlds largest estuary, each species have developed brackish water ecotypes capable of thriving at salinities exceeding their internal salinity. This requires fundamentally different cellular functions and is lethal to non-adapted freshwater individuals. However, their evolutionary histories and functional genomic adaptations are unknown. Through deep sequencing of brackish water and freshwater ecotypes of perch and pike, Project BrackAdapt aims to identify the demographic and evolutionary history of each species. The project will identify genomic regions under selection for salinity tolerance and investigate whether genomic adaptations to environmental changes are parallel in function, time and space within and between species. The training and project management experience I will gain during the project will be a stepping-stone for my career to advance and make me an independent researcher.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural.

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Coordinador

LUNDS UNIVERSITET
Aportación neta de la UEn
€ 222 727,68
Dirección
Paradisgatan 5c
22100 Lund
Suecia

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Región
Södra Sverige Sydsverige Skåne län
Tipo de actividad
Higher or Secondary Education Establishments
Enlaces
Coste total
Sin datos