Objectif
Molecular Dynamics Simulations (MD) are widely used in molecular and structural biology and drug discovery to study the structure, properties and dynamics of small and macromolecules. The size of the simulated systems (up to a billion atoms) and the length of the simulations (from microseconds in 2010 to milliseconds in 2021 in million atom scenes) have dramatically increased following the recent advances in computing hardware (GPU clusters) and storage. Additionally, with the recent advances in Cryo Electron Microscopy and the arising of AlphaFold many new models of macromolecular structures and complexes are now available for molecular simulation.
Due to their more and more extreme size, the storage, analysis and visualization of the resulting data is becoming problematic: 1. Technically for a usable and efficient processing of the data and 2. Environmentally in terms of storage, bandwith and power comsumption.
Within the ERC ViDOCK project, we created a highly usable, free and open-source high-performance molecular visualization software called VTX. VTX is optimized to handle the biggest molecular structures and trajectories notably by including cutting-edge molecular graphics with a high performance graphics engine coupled with a video game based minimalistic task-oriented GUI to maximize its usability.
The goal of the VTX-HPC project is to improve the performance, usability and sustainability of VTX for the visualization of the High Performance Computing Molecular Dynamics Simulations big data by developing and implementing 1. a highly compact molecular structure and trajectories file format optimized for streaming for increased performances and reduced environmental load. 2. a meshless version of the widely used Solvent Excluded Surface representation for scalability purposes and real-time ray tracing in the rendering engines and 3. Adapted manipulation and controls for the generation of illustrations and movies of massive dynamic molecular scenes.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- sciences naturelles informatique et science de l'information logiciel
- sciences naturelles sciences physiques optique microscopie
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-ERC-POC - HORIZON ERC Proof of Concept Grants
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2022-POC1
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
75141 Paris
France
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.