Training Alliance for Computational Systems chemistry

Información del proyecto

TACsy

Identificador del acuerdo de subvención: 101072930

DOI

10.3030/101072930

Fecha de la firma de la CE 6 Julio 2022

Fecha de inicio 1 Marzo 2023

Fecha de finalización 28 Febrero 2027

Financiado con arreglo a

• Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)

Coste total

Sin datos

Aportación de la UE

€ 3 872 336,40

Coordinado por

SYDDANSK UNIVERSITET
Denmark

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Los enlaces a los documentos y las publicaciones de los proyectos del Séptimo Programa Marco, así como los enlaces a algunos tipos de resultados específicos, como conjuntos de datos y «software», se obtienen dinámicamente de OpenAIRE .

Resultado final

Websites, patent fillings, videos etc. (1)

Project website

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Publicaciones

Peer reviewed articles (9)

On Finding All Connected Maximum-Sized Common Subgraphs in Multiple Labeled Graphs

Autores: Johannes B.S. Petersen, Akbar Davoodi, Thomas Gärtner, Marc Hellmuth, Daniel Merkle
Publicado en: ARXIV, 2025
Editor: ARXIV
DOI: 10.48550/ARXIV.2503.22368

SynCat: A light weight graph neural network model to classify chemical reactions

Autores: Phuoc-Chung Van Nguyen, Van-Thinh To, Ngoc-Vi Nguyen Tran, Tieu-Long Phan, Tuyen Ngoc Truong, Thomas Gärtner, Daniel Merkle, Peter F. Stadler
Publicado en: 2025
Editor: American Chemical Society (ACS)
DOI: 10.26434/CHEMRXIV-2025-5F868

A Sensitivity Analysis Methodology for Rule-Based Stochastic Chemical Systems

Autores: Erika M. Herrera Machado, Jakob L. Andersen, Rolf Fagerberg, Daniel Merkle
Publicado en: Journal of Chemical Information and Modeling, 2026
Editor: ACS Publications
DOI: 10.1021/ACS.JCIM.5C02375

Finding Thermodynamically Favorable Pathways in Chemical Reaction Networks Using Flows in Hypergraphs and Mixed-Integer Linear Programming

Autores: Adittya Pal, Rolf Fagerberg, Jakob Lykke Andersen, Christoph Flamm, Peter Dittrich, Daniel Merkle
Publicado en: Journal of Chemical Information and Modeling, Edición 65, 2025, ISSN 1549-9596
Editor: American Chemical Society (ACS)
DOI: 10.1021/ACS.JCIM.5C00265

<tt>SynTemp</tt>: Efficient Extraction of Graph-Based Reaction Rules from Large-Scale Reaction Databases

Autores: Tieu-Long Phan, Klaus Weinbauer, Marcos E. González Laffitte, Yingjie Pan, Daniel Merkle, Jakob L. Andersen, Rolf Fagerberg, Christoph Flamm, Peter F. Stadler
Publicado en: Journal of Chemical Information and Modeling, Edición 65, 2025, ISSN 1549-9596
Editor: American Chemical Society (ACS)
DOI: 10.1021/ACS.JCIM.4C01795

Computational approaches in chemical space exploration for carbon fixation pathways

Autores: Anne-Susann Abel, Nino Lauber, Jakob Lykke Andersen, Rolf Fagerberg, Daniel Merkle, Christoph Flamm
Publicado en: npj Systems Biology and Applications, Edición 12, 2026, ISSN 2056-7189
Editor: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41540-025-00641-8

Partial Imaginary Transition State (ITS) Graphs: A Formal Framework for Research and Analysis of Atom-to-Atom Maps of Unbalanced Chemical Reactions and Their Completions

Autores: Marcos E. González Laffitte, Klaus Weinbauer, Tieu-Long Phan, Nora Beier, Nico Domschke, Christoph Flamm, Thomas Gatter, Daniel Merkle, Peter F. Stadler
Publicado en: Symmetry, Edición 16, 2025, ISSN 2073-8994
Editor: MDPI AG
DOI: 10.3390/SYM16091217

<tt>SynKit</tt> : A Graph-Based Python Framework for Rule-Based Reaction Modeling and Analysis

Autores: Tieu-Long Phan, Marcos E. González Laffitte, Klaus Weinbauer, Daniel Merkle, Jakob Lykke Andersen, Rolf Fagerberg, Thomas Gatter, Peter F. Stadler
Publicado en: Journal of Chemical Information and Modeling, Edición 65, 2025, ISSN 1549-9596
Editor: American Chemical Society (ACS)
DOI: 10.1021/ACS.JCIM.5C02123

Reaction rebalancing: a novel approach to curating reaction databases

Autores: Tieu-Long Phan, Klaus Weinbauer, Thomas Gärtner, Daniel Merkle, Jakob L. Andersen, Rolf Fagerberg, Peter F. Stadler
Publicado en: Journal of Cheminformatics, Edición 16, 2024, ISSN 1758-2946
Editor: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1186/s13321-024-00875-4

Conference proceedings (1)

Extension of Partial Atom-To-Atom Maps: Uniqueness and Algorithms

Autores: Marcos E. González Laffitte, Tieu-Long Phan, and Peter F. Stadler
Publicado en: 25th International Conference on Algorithms for Bioinformatics (WABI 2025), 2025
Editor: DAGSTUHL PUBLISHING
DOI: 10.4230/LIPICS.WABI.2025.12