Training Alliance for Computational Systems chemistry

Informations projet

TACsy

N° de convention de subvention: 101072930

DOI

10.3030/101072930

Date de signature de la CE 6 Juillet 2022

Date de début 1 Mars 2023

Date de fin 28 Février 2027

Financé au titre de

• Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)

Coût total

Aucune donnée

Contribution de l’UE

€ 3 872 336,40

Coordonné par

SYDDANSK UNIVERSITET
Denmark

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Websites, patent fillings, videos etc. (1)

Project website

Project website including purpose/mission, contact information, recruitment information, and other data relevant for the public.

Publications

Peer reviewed articles (9)

On Finding All Connected Maximum-Sized Common Subgraphs in Multiple Labeled Graphs

Auteurs: Johannes B.S. Petersen, Akbar Davoodi, Thomas Gärtner, Marc Hellmuth, Daniel Merkle
Publié dans: ARXIV, 2025
Éditeur: ARXIV
DOI: 10.48550/ARXIV.2503.22368

SynCat: A light weight graph neural network model to classify chemical reactions

Auteurs: Phuoc-Chung Van Nguyen, Van-Thinh To, Ngoc-Vi Nguyen Tran, Tieu-Long Phan, Tuyen Ngoc Truong, Thomas Gärtner, Daniel Merkle, Peter F. Stadler
Publié dans: 2025
Éditeur: American Chemical Society (ACS)
DOI: 10.26434/CHEMRXIV-2025-5F868

A Sensitivity Analysis Methodology for Rule-Based Stochastic Chemical Systems

Auteurs: Erika M. Herrera Machado, Jakob L. Andersen, Rolf Fagerberg, Daniel Merkle
Publié dans: Journal of Chemical Information and Modeling, 2026
Éditeur: ACS Publications
DOI: 10.1021/ACS.JCIM.5C02375

Finding Thermodynamically Favorable Pathways in Chemical Reaction Networks Using Flows in Hypergraphs and Mixed-Integer Linear Programming

Auteurs: Adittya Pal, Rolf Fagerberg, Jakob Lykke Andersen, Christoph Flamm, Peter Dittrich, Daniel Merkle
Publié dans: Journal of Chemical Information and Modeling, Numéro 65, 2025, ISSN 1549-9596
Éditeur: American Chemical Society (ACS)
DOI: 10.1021/ACS.JCIM.5C00265

<tt>SynTemp</tt>: Efficient Extraction of Graph-Based Reaction Rules from Large-Scale Reaction Databases

Auteurs: Tieu-Long Phan, Klaus Weinbauer, Marcos E. González Laffitte, Yingjie Pan, Daniel Merkle, Jakob L. Andersen, Rolf Fagerberg, Christoph Flamm, Peter F. Stadler
Publié dans: Journal of Chemical Information and Modeling, Numéro 65, 2025, ISSN 1549-9596
Éditeur: American Chemical Society (ACS)
DOI: 10.1021/ACS.JCIM.4C01795

Computational approaches in chemical space exploration for carbon fixation pathways

Auteurs: Anne-Susann Abel, Nino Lauber, Jakob Lykke Andersen, Rolf Fagerberg, Daniel Merkle, Christoph Flamm
Publié dans: npj Systems Biology and Applications, Numéro 12, 2026, ISSN 2056-7189
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41540-025-00641-8

Partial Imaginary Transition State (ITS) Graphs: A Formal Framework for Research and Analysis of Atom-to-Atom Maps of Unbalanced Chemical Reactions and Their Completions

Auteurs: Marcos E. González Laffitte, Klaus Weinbauer, Tieu-Long Phan, Nora Beier, Nico Domschke, Christoph Flamm, Thomas Gatter, Daniel Merkle, Peter F. Stadler
Publié dans: Symmetry, Numéro 16, 2025, ISSN 2073-8994
Éditeur: MDPI AG
DOI: 10.3390/SYM16091217

<tt>SynKit</tt> : A Graph-Based Python Framework for Rule-Based Reaction Modeling and Analysis

Auteurs: Tieu-Long Phan, Marcos E. González Laffitte, Klaus Weinbauer, Daniel Merkle, Jakob Lykke Andersen, Rolf Fagerberg, Thomas Gatter, Peter F. Stadler
Publié dans: Journal of Chemical Information and Modeling, Numéro 65, 2025, ISSN 1549-9596
Éditeur: American Chemical Society (ACS)
DOI: 10.1021/ACS.JCIM.5C02123

Reaction rebalancing: a novel approach to curating reaction databases

Auteurs: Tieu-Long Phan, Klaus Weinbauer, Thomas Gärtner, Daniel Merkle, Jakob L. Andersen, Rolf Fagerberg, Peter F. Stadler
Publié dans: Journal of Cheminformatics, Numéro 16, 2024, ISSN 1758-2946
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1186/s13321-024-00875-4

Conference proceedings (1)

Extension of Partial Atom-To-Atom Maps: Uniqueness and Algorithms

Auteurs: Marcos E. González Laffitte, Tieu-Long Phan, and Peter F. Stadler
Publié dans: 25th International Conference on Algorithms for Bioinformatics (WABI 2025), 2025
Éditeur: DAGSTUHL PUBLISHING
DOI: 10.4230/LIPICS.WABI.2025.12