Description du projet
Une étude examine le rôle des ubiquitines ligases E3 TRIM dans le système immunitaire des poissons
La famille des motifs tripartites (TRIM) est une famille de protéines impliquée dans un large éventail de processus biologiques, notamment la prolifération cellulaire, la différenciation, le développement, l’apoptose et l’immunité innée. Le projet FishTRIM, financé par l’UE, étudiera l’évolution et la fonction de la famille TRIM des ubiquitines ligases E3 chez les poissons. Certains éléments suggèrent que cette famille de protéines pourrait agir comme un mécanisme immunitaire contre des agents pathogènes viraux spécifiques; par conséquent, les expansions répétées et indépendantes du répertoire TRIM chez les poissons pourraient être le résultat d’une course à l’armement entre les poissons et les virus. Les chercheurs tireront parti des progrès récents de la génétique fonctionnelle et de la génomique, tels que les technologies de la cellule unique et l’édition du génome, pour étudier la fonction des gènes à une échelle et à une résolution sans précédent.
Objectif
FishTRIM aims to study the evolution and function of the TRIM family of E3 ubiquitin ligases in fish. This family has undergone several clade-specific expansions across the fish phylogeny, with single-copy mammalian TRIMs frequently present in large numbers in fish genomes. TRIM E3 ligases and their direct interactions with viral proteins are key in host-pathogen relationships, and several fish TRIMs have been associated to antiviral responses. Additionally, positive selection has been observed in fish TRIM protein domains involved in protein-protein interactions and pathogen recognition. This suggests that this family of fish E3 ubiquitin ligases may act as an immune mechanism against specific viral pathogens, and therefore the repeated independent expansions of the TRIM repertoire in fish could be the result of an arms race between fish and viruses. To address these questions, FishTRIM will focus on understanding the function of this family in fish, and their potential co-evolutionary interactions with viruses. Recent advances in the fields of functional genetics and genomics, such as single-cell technologies and genome editing, allow us to interrogate gene function at unprecedented scale and resolution. Nonetheless, a phylogenomic approach will be fundamental to determine potential functional overlap across independent expansions, and selection patterns in the context of TRIM protein domains will contribute to illuminate the function of the expanded TRIM repertoire. FishTRIM aims to deliver frontier knowledge on the biological significance of the different fish TRIM expansions, with potential to revolutionise our understanding of fish immune systems and the evolution of the ubiquitination machinery. FishTRIM will also explore the role of TRIMs in resistance to viral diseases in fish, with potential transformative outcomes leading to improved fish welfare and food security.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
La classification de ce projet a été validée par l'équipe qui en a la charge.
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2022-STG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
15782 SANTIAGO DE COMPOSTELA
Espagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.