Descripción del proyecto
Análisis detallado de las comunidades microbianas
Los microbios desempeñan un papel fundamental, desde el descubrimiento de nuevos antibióticos a la conversión de residuos en compost.Son los principales productores de productos naturales útiles, ya que descomponen la materia orgánica de plantas, animales y otros microbios. No obstante, se sabe poco sobre las comunidades microbianas. El proyecto NanoEat, financiado con fondos europeos, proporcionará nuevos conocimientos sobre su papel en la biosfera y en la solución de problemas medioambientales. En concreto, se empleará la secuenciación con nanoporos y el aprendizaje automático para identificar patrones de modificación específicos de cada especie y estimar el crecimiento a escala en comunidades complejas. El equipo del proyecto aprovechará la característica del ADN modificado en los microbios para responder preguntas fundamentales sobre la presencia y la actividad microbianas.
Objetivo
MicMicrobial communities play a vital role in most processes in the biosphere and are essential for solving present and future environmental challenges. Examples include the impact of the human microbiome on health and disease, the discovery of new antibiotics, and turning waste products into valuables. In the past 10 years, new DNA sequencing-based methods have revolutionized our access to the genomes of microbial communities and have sparked an explosion of new fundamental discoveries based on genomic evidence.
However, despite the fundamental discoveries enabled by new methods in the past decade, we are far from having a meaningful genomic representation of the tree of life - and we are even further away from understanding how microbes realize their genomic potential in complex environments. This is underlined by the fact that the current microbial genome databases contain genomic information on 47,894 prokaryotic species, while the most conservative analysis estimates millions of different species in nature.
The NanoEat project will enable the next generation of large-scale studies in microbial communities to answer the fundamental questions of who is there and what do they eat. In nature, most microbes modify their DNA in highly specific combinations, either as a defense system against viruses or to regulate activity. In NanoEat we will exploit this feature using the raw Nanopore sequencing signal that, in principle, enables discovery of any type of modified DNA. By developing new machine learning frameworks that can identify these species-specific modification patterns we can utilize this novel feature to supercharge recovery of individual microbial genomes from complex communities. Furthermore, by supplying synthetic nucleotides, that can be detected by Nanopore sequencing, we hypothesize that it is possible to estimate how microbes grow, by using the incorporation rate of these synthetic nucleotides to estimate replication in complex communities at scale.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales informática y ciencias de la información base de datos
- ciencias naturales ciencias biológicas microbiología virología
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias naturales ciencias biológicas genética nucleótido
- ciencias naturales ciencias biológicas genética genoma
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2022-STG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
9220 Aalborg
Dinamarca
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.