Descripción del proyecto
Aprovechamiento de la edición genómica colateral
La edición genómica se basa en la rotura selectiva de la doble cadena de una secuencia de interés. Esto es lo que hacen las nucleasas programables de los microbios. Pueden degradar el ADN de los virus que infectan a los microbios (fagos) y, así, dejar intacto el ADN microbiano. Hay miles de nucleasas programables en los genomas microbianos, pero se sabe muy poco sobre sus acciones. La falta de «paridad guía-objetivo» (cortar solo sitios del genoma objetivo totalmente coincidentes) es una preocupación importante. El equipo del proyecto PROTEGE, financiado por el Consejo Europeo de Investigación, pretende convertir esto en una ventaja. El equipo utilizará bioquímica de alto rendimiento para perfilar nucleasas en función de la especificidad de la paridad guía-objetivo, crear un conjunto de herramientas para evaluarla y comprobar si la «desprogramación» intencionada de nucleasas puede dirigir resultados de reparación específicos.
Objetivo
Programmable nucleases reside at the nexus of advanced gene editing and microbial defense. These nucleases degrade phage DNA but avoid genomic DNA to provide the microbe with adaptive immunity. The standard-bearer, CRISPR-Cas9, relies on a guide RNA (gRNA) – its program – to precisely cut a complimentary genetic sequence – its target – for precision gene editing. These programmable nucleases deliver cure for genetic diseases like anemia, blindness, and cancer; quick disease model development; and diagnostics for viruses like SARS-CoV-2.
Hunts across microbial genomes have exposed thousands of programmable nucleases. Each could be another valuable tool for genome engineers, but we know just too little about them to use them safely. Even Cas9 does not have guide-target parity: It cuts partially matched ‘off-target’ genome sites, which can lead to dangerous side effects. Though we work hard to avoid off-targets, partial matching may have a bright side. What if we leverage it, using it to make gene editing more predictable?
Using high-throughput biochemistry, we will Profile nucleases and Repurpose Off-Targets to Expand Gene Editing. The PROTÉGÉ research program will profile guide-target parity – specificity – across promising, newly discovered programmable nucleases. It will deliver a toolset for assessing this critical safety feature rapidly and broadly. Finally, we will test the hypothesis that purposefully misprogramming nucleases can direct specific repair outcomes. We intended to benefit Europe and the world community with safer and more diverse gene editing tools for achieving its Horizon Europe health, technology and environmental goals.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. La clasificación de este proyecto ha sido validada por su equipo.
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. La clasificación de este proyecto ha sido validada por su equipo.
Programa(s)
- HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC) Main Programme
Convocatoria de propuestas
(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2022-STG
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HORIZON-ERC -Institución de acogida
01513 Vilnius
Lituania