Descrizione del progetto
Sfruttare l’editing genico off-target
L’editing genico si basa sulla creazione di una rottura mirata del doppio filamento in una sequenza di interesse. Le «nucleasi programmabili» trovate nei microbi fanno proprio questo. Possono degradare il DNA dei virus che infettano i microbi (fagi), lasciando intatto il DNA microbico. Nei genomi microbici sono presenti migliaia di nucleasi programmabili, ma si sa ancora troppo poco sulle loro azioni. La mancanza di «parità guida-target» (taglio solo di siti genomici target completamente corrispondenti) è un problema significativo. Il progetto PROTEGE, finanziato dal CER, intende trasformare questa situazione in un vantaggio. Il team utilizzerà la biochimica ad alto rendimento per profilare le nucleasi in base alla specificità della parità tra guida e bersaglio, creerà un set di strumenti per valutare questo aspetto e verificherà se la «programmazione errata» intenzionale delle nucleasi può indirizzare risultati di riparazione specifici.
Obiettivo
Programmable nucleases reside at the nexus of advanced gene editing and microbial defense. These nucleases degrade phage DNA but avoid genomic DNA to provide the microbe with adaptive immunity. The standard-bearer, CRISPR-Cas9, relies on a guide RNA (gRNA) – its program – to precisely cut a complimentary genetic sequence – its target – for precision gene editing. These programmable nucleases deliver cure for genetic diseases like anemia, blindness, and cancer; quick disease model development; and diagnostics for viruses like SARS-CoV-2.
Hunts across microbial genomes have exposed thousands of programmable nucleases. Each could be another valuable tool for genome engineers, but we know just too little about them to use them safely. Even Cas9 does not have guide-target parity: It cuts partially matched ‘off-target’ genome sites, which can lead to dangerous side effects. Though we work hard to avoid off-targets, partial matching may have a bright side. What if we leverage it, using it to make gene editing more predictable?
Using high-throughput biochemistry, we will Profile nucleases and Repurpose Off-Targets to Expand Gene Editing. The PROTÉGÉ research program will profile guide-target parity – specificity – across promising, newly discovered programmable nucleases. It will deliver a toolset for assessing this critical safety feature rapidly and broadly. Finally, we will test the hypothesis that purposefully misprogramming nucleases can direct specific repair outcomes. We intended to benefit Europe and the world community with safer and more diverse gene editing tools for achieving its Horizon Europe health, technology and environmental goals.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. La classificazione di questo progetto è stata convalidata dal team del progetto.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. La classificazione di questo progetto è stata convalidata dal team del progetto.
Programma(i)
- HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC) Main Programme
Argomento(i)
Invito a presentare proposte
(si apre in una nuova finestra) ERC-2022-STG
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HORIZON-ERC -Istituzione ospitante
01513 Vilnius
Lituania