Training AlliancE for Novel Microbiome-Modulating TherapieS

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Call 1 - Report on dissemination activities

Report the disemmination activities by Dates/interval of call publication and dissemination channels (supporting documents); Information produced for call dissemination like flyers, brochures; Presentations at conferences, meetings, etc.; articles published in the press or other advertising

Call1 - Link to Euraxess website

Information to the Project Officer on published calls by sending the link to the Euraxess website and a screen shot of the related call document

Publications

Mibianto: ultra-efficient online microbiome analysis through <i>k</i>-mer based metagenomics

Auteurs: Pascal Hirsch, Leidy-Alejandra G Molano, Annika Engel, Jens Zentgraf, Sven Rahmann, Matthias Hannig, Rolf Müller, Fabian Kern, Andreas Keller, Georges P Schmartz
Publié dans: Nucleic Acids Research, Numéro 52, 2024, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/NAR/GKAE364

Decoding the diagnostic and therapeutic potential of microbiota using pan-body pan-disease microbiomics

Auteurs: Georges P. Schmartz, Jacqueline Rehner, Madline P. Gund, Verena Keller, Leidy-Alejandra G. Molano, Stefan Rupf, Matthias Hannig, Tim Berger, Elias Flockerzi, Berthold Seitz, Sara Fleser, Sabina Schmitt-Grohé, Sandra Kalefack, Michael Zemlin, Michael Kunz, Felix Götzinger, Caroline Gevaerd, Thomas Vogt, Jörg Reichrath, Lisa Diehl, Anne Hecksteden, Tim Meyer, Christian Herr, Alexey Gurevich, Daniel Krug, Julian Hegemann, Kenan Bozhueyuek, Tobias A. M. Gulder, Chengzhang Fu, Christine Beemelmanns, Jörn M. Schattenberg, Olga V. Kalinina, Anouck Becker, Marcus Unger, Nicole Ludwig, Martina Seibert, Marie-Louise Stein, Nikolas Loka Hanna, Marie-Christin Martin, Felix Mahfoud, Marcin Krawczyk, Sören L. Becker, Rolf Müller, Robert Bals, Andreas Keller
Publié dans: Nature Communications, Numéro 15, 2024, ISSN 2041-1723
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41467-024-52598-7

Joint Bacterial Traces in the Gut and Oral Cavity of Obesity Patients Provide Evidence for Saliva as a Rich Microbial Biomarker Source

Auteurs: Jacqueline Rehner, Madline Gund, Sören L. Becker, Matthias Hannig, Stefan Rupf, Jörn M. Schattenberg, Andreas Keller, null null, Leidy-Alejandra G. Molano, Verena Keller
Publié dans: Nutrients, Numéro 17, 2025, ISSN 2072-6643
Éditeur: MDPI AG
DOI: 10.3390/NU17223527

SmallBARNA 2026: a kingdom-wide bacterial sRNA resource

Auteurs: Shusruto Rishik, Leidy Alejandra G Molano, Syed Mohammed Khalid, Tiniko Babalashvili, Fadlilah Nur Hasanah, Md Mobashir Rahman, Pascal Hirsch, Friederike Grandke, Emma S Hoffmann, Tobias W Wolff, Georges P Schmartz, Andreas Keller
Publié dans: Nucleic Acids Research, Numéro 54, 2026, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/NAR/GKAF999

Benchmarking large language models for pathogen–disease classification in post-acute infection syndromes

Auteurs: Syed Mohammed Khalid, Tom Wölker, Leidy-Alejandra G Molano, Simon Graf, Andreas Keller
Publié dans: Briefings in Bioinformatics, Numéro 27, 2026, ISSN 1467-5463
Éditeur: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1101/2025.06.30.662395

Probiotics as an adjunctive therapy in periodontitis treatment—reality or illusion—a clinical perspective

Auteurs: Baddouri, L., Hannig, M.
Publié dans: npj biofilms and microbiomes, Numéro 10, ISSN 2055-5008
Éditeur: Springer Nature
DOI: 10.1038/S41522-024-00614-5

The PLSDB 2025 update: enhanced annotations and improved functionality for comprehensive plasmid research

Auteurs: Leidy-Alejandra G Molano, Pascal Hirsch, Matthias Hannig, Rolf Müller, Andreas Keller
Publié dans: Nucleic Acids Research, Numéro 53, 2025, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/NAR/GKAE1095

A multivalent TAT–arginine-biodynamer conjugate targeting the bacterial cell envelope via specific membrane interactions

Auteurs: Mohamed A.M. Kamal, Walaa M. Metwally, Justine Bassil, Bart-Jan Niebuur, Tobias Kraus, Jennifer Herrmann, Marcus Koch, Anna K.H. Hirsch, Brigitta Loretz, Sangeun Lee, Claus-Michael Lehr
Publié dans: Biomedicine & Pharmacotherapy, Numéro 198, 2026, ISSN 0753-3322
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.BIOPHA.2026.119304

Probiotic Lactobacillus rhamnosus mitigates PBC-like features in Mcpip1-deficient mice via modulation of gut-liver crosstalk

Auteurs: Katarzyna Trzos, Tomasz Hutsch, Anastasiia Koval, Danuta Śmierciak, Gabriela Machaj, Leidy-Alejandra G. Molano, Jacqueline Rehner, Md Mobashir Rahman, Maximilian Olaf Förster, Marcin Bednarek, Bahtiyar Yilmaz, Magdalena Pilarczyk-Zurek, Szymon Surma, Joanna Koziel, Marcin Krawczyk, Andreas Keller, Sören L. Becker, Guillem Ylla, Jolanta Jura, Jerzy Kotlinowski
Publié dans: Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Basis of Disease, Numéro 1872, 2026, ISSN 0925-4439
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.BBADIS.2026.168216

Examining spatial microbiome variations across gastrointestinal tract regions in obesity

Auteurs: Jacqueline Rehner, Leidy-Alejandra G. Molano, Chara Christodoulou, Sebastian Holländer, Maximilian O. Förster, Verena Keller, Johannes Jäger, Sara Volz-Willems, Sören L. Becker, Matthias Glanemann, Michael Jelden
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 15, 2025, ISSN 2045-2322
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41598-025-10931-0

MCPmed: a call for Model Context Protocol-enabled bioinformatics web services for LLM-driven discovery

Auteurs: Matthias Flotho, Ian Ferenc Diks, Philipp Flotho, Leidy-Alejandra G Molano, Pascal Hirsch, Andreas Keller
Publié dans: Briefings in Bioinformatics, Numéro 27, 2026, ISSN 1467-5463
Éditeur: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/BIB/BBAG076

Exploring microbial diversity and biosynthetic potential in zoo and wildlife animal microbiomes

Auteurs: Georges P. Schmartz, Jacqueline Rehner, Miriam J. Schuff, Leidy-Alejandra G. Molano, Sören L. Becker, Marcin Krawczyk, Azat Tagirdzhanov, Alexey Gurevich, Richard Francke, Rolf Müller, Verena Keller, Andreas Keller
Publié dans: Nature Communications, Numéro 15, 2024, ISSN 2041-1723
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41467-024-52669-9

HERA: a web server for host element reference-based aligner

Auteurs: Leidy-Alejandra G Molano, Pascal Hirsch, Andreas Keller, Monika Dolejska, Jana Palkovicova
Publié dans: Nucleic Acids Research, Numéro 54, 2026, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/NAR/GKAG448

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