Medical Image Analysis with Normative Machine Learning

Informations projet

MIA-NORMAL

N° de convention de subvention: 101083647

DOI

10.3030/101083647

Date de signature de la CE 24 Avril 2023

Date de début 1 Septembre 2023

Date de fin 31 Août 2028

Financé au titre de

• European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 997 841,00

Contribution de l’UE

€ 1 997 841,00

Coordonné par

FRIEDRICH-ALEXANDER-UNIVERSITAET ERLANGEN-NUERNBERG
Germany

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Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Publications

Conference proceedings (28)

Image-Conditioned Diffusion Models for Medical Anomaly Detection

Auteurs: Baugh, Matthew; Reynaud, Hadrien; Marimont, Sergio Naval; Cechnicka, Sarah; Müller, Johanna P.; Tarroni, Giacomo; Kainz, Bernhard
Publié dans: 2024
Éditeur: Springer, Cham
DOI: 10.1007/978-3-031-73158-7_11

Robust Segmentation via Topology Violation Detection and Feature Synthesis

Auteurs: Li, Liu; Ma, Qiang; Ouyang, Cheng; Li, Zeju; Meng, Qingjie; Zhang, Weitong; Qiao, Mengyun; Kyriakopoulou, Vanessa; Hajnal, Joseph V.; Rueckert, Daniel; Kainz, Bernhard
Publié dans: 2023
Éditeur: Springer, Cham.
DOI: 10.1007/978-3-031-43901-8_7

EchoNet-Synthetic: Privacy-Preserving Video Generation for Safe Medical Data Sharing

Auteurs: Hadrien Reynaud, Qingjie Meng, Mischa Dombrowski, Arijit Ghosh, Thomas Day, Alberto Gomez, Paul Leeson, Bernhard Kainz
Publié dans: Lecture Notes in Computer Science, Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention – MICCAI 2024, 2024
Éditeur: Springer Nature Switzerland
DOI: 10.48550/ARXIV.2406.00808

DISYRE: Diffusion-Inspired Synthetic Restoration for Unsupervised Anomaly Detection

Auteurs: Marimont, Sergio Naval; Baugh, Matthew; Siomos, Vasilis; Tzelepis, Christos; Kainz, Bernhard; Tarroni, Giacomo
Publié dans: 2024 IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), 2024
Éditeur: IEEE
DOI: 10.48550/ARXIV.2311.15453

Feature-Conditioned Cascaded Video Diffusion Models for Precise Echocardiogram Synthesis

Auteurs: Reynaud, Hadrien; Qiao, Mengyun; Dombrowski, Mischa; Day, Thomas; Razavi, Reza; Gomez, Alberto; Leeson, Paul; Kainz, Bernhard
Publié dans: Lecture Notes in Computer Science ((LNCS,volume 14229)), 2023
Éditeur: Spinger, Cham.
DOI: 10.48550/ARXIV.2303.12644

Learnable Slice-to-volume Reconstruction for Motion Compensation in Fetal Magnetic Resonance Imaging

Auteurs: Jehn, Constantin; Müller, Johanna P.; Kainz, Bernhard
Publié dans: 2023
Éditeur: Springer Vieweg, Wiesbaden
DOI: 10.1007/978-3-658-41657-7_10

Keynote: Beyond Supervised Learning

Auteurs: Kainz, Bernhard
Publié dans: 2023
Éditeur: Springer Vieweg, Wiesbaden
DOI: 10.1007/978-3-658-41657-7_1

Whole Slide Multiple Instance Learning for Predicting Axillary Lymph Node Metastasis

Auteurs: Shkëmbi, Glejdis; Müller, Johanna P.; Li, Zhe; Breininger, Katharina; Schüffler, Peter; Kainz, Bernhard
Publié dans: 2023
Éditeur: Springer, Cham
DOI: 10.1007/978-3-031-44992-5_2

Data-Efficient Generation for Dataset Distillation

Auteurs: Zhe Li, Weitong Zhang, Sarah Cechnicka, Bernhard Kainz
Publié dans: Lecture Notes in Computer Science, Computer Vision – ECCV 2024 Workshops, 2025
Éditeur: Springer Nature Switzerland
DOI: 10.48550/ARXIV.2409.03929

Conditional Temporal Attention Networks for Neonatal Cortical Surface Reconstruction

Auteurs: Ma, Qiang; Li, Liu; Kyriakopoulou, Vanessa; Hajnal, Joseph V.; Robinson, Emma C.; Kainz, Bernhard; Rueckert, Daniel
Publié dans: Lecture Notes in Computer Science ((LNCS,volume 14223)), 2023
Éditeur: Springer, Cham
DOI: 10.48550/ARXIV.2307.11870

Stability and generalizability in sde diffusion models with measure-preserving dynamics

Auteurs: Zhang, Weitong; Zang, Chengqi; Li, Liu; Cechnicka, Sarah; Ouyang, Cheng; Kainz, Bernhard
Publié dans: 2025
Éditeur: ACM
DOI: 10.48550/ARXIV.2406.13652

Style-Extracting Diffusion Models for Semi-supervised Histopathology Segmentation

Auteurs: Öttl, Mathias; Wilm, Frauke; Steenpass, Jana; Qiu, Jingna; Rübner, Matthias; Hartmann, Arndt; Beckmann, Matthias; Fasching, Peter; Maier, Andreas; Erber, Ramona; Kainz, Bernhard; Breininger, Katharina
Publié dans: 2024
Éditeur: Springer, Cham
DOI: 10.48550/ARXIV.2403.14429

MoCoSR: Respiratory Motion Correction and Super-Resolution for 3D Abdominal MRI

Auteurs: Zhang, Weitong; Basaran, Berke; Meng, Qingjie; Baugh, Matthew; Stelter, Jonathan; Lung, Phillip; Patel, Uday; Bai, Wenjia; Karampinos, Dimitrios; Kainz, Bernhard
Publié dans: 2023
Éditeur: Springer, Cham.
DOI: 10.1007/978-3-031-43999-5_12

Many Tasks Make Light Work: Learning to Localise Medical Anomalies from Multiple Synthetic Tasks

Auteurs: Baugh, Matthew; Tan, Jeremy; Müller, Johanna P.; Dombrowski, Mischa; Batten, James; Kainz, Bernhard
Publié dans: 2023
Éditeur: Springer, Cham
DOI: 10.48550/ARXIV.2307.00899

Confidence-Aware and Self-supervised Image Anomaly Localisation

Auteurs: Johanna P. Müller; Matthew Baugh; Jeremy Tan; Mischa Dombrowski; Bernhard Kainz
Publié dans: Lecture Notes in Computer Science ISBN: 9783031443350, 2023
Éditeur: Springer, Cham
DOI: 10.48550/ARXIV.2303.13227

Unsupervised Single-source Domain Generalization for Robust Quantification of Lymphatic Perfusion

Auteurs: Fischer, Lisa K.; Müller, Johanna P.; Schröder, Christian; Hanser, Anja; Cuomo, Michela; Day, Thomas; Ouyang, Cheng; Dewald, Oliver; Rompel, Oliver; Dittrich, Sven; Küstner, Thomas; Kainz, Bernhard
Publié dans: 2025
Éditeur: Springer Vieweg, Wiesbaden
DOI: 10.1007/978-3-658-47422-5_40

Weakly Supervised Learning of Cortical Surface Reconstruction from Segmentations

Auteurs: Ma, Qiang; Li, Liu; Robinson, Emma C.; Kainz, Bernhard; Rueckert, Daniel
Publié dans: 2024
Éditeur: Springer, Cham
DOI: 10.48550/ARXIV.2406.12650

Realistic Data Enrichment for Robust Image Segmentation in Histopathology

Auteurs: Cechnicka, Sarah; Ball, James; Reynaud, Hadrien; Arthurs, Callum; Roufosse, Candice; Kainz, Bernhard
Publié dans: 2023
Éditeur: Springer, Cham.
DOI: 10.48550/ARXIV.2304.09534

URCDM: Ultra-Resolution Image Synthesis in Histopathology

Auteurs: Cechnicka, Sarah; Ball, James; Baugh, Matthew; Reynaud, Hadrien; Simmonds, Naomi; Smith, Andrew P. T.; Horsfield, Catherine; Roufosse, Candice; Kainz, Bernhard
Publié dans: 2024
Éditeur: Springer, Cham.
DOI: 10.48550/ARXIV.2407.13277

Resource-Efficient Medical Image Analysis with Self-adapting Forward-Forward Networks

Auteurs: Müller, Johanna P.; Kainz, Bernhard
Publié dans: Lecture Notes in Computer Science ((LNCS,volume 15242)), 2024
Éditeur: Springer, Cham
DOI: 10.48550/ARXIV.2406.14038

Arc2Face: A Foundation Model for ID-Consistent Human Faces

Auteurs: Papantoniou, Foivos Paraperas; Lattas, Alexandros; Moschoglou, Stylianos; Deng, Jiankang; Kainz, Bernhard; Zafeiriou, Stefanos
Publié dans: 18th European Conference, Milan, Italy, September 29–October 4, 2024, Proceedings, Part XXXVII, 2024
Éditeur: Springer Cham.
DOI: 10.48550/ARXIV.2403.11641

Foreground-Background Separation through Concept Distillation from Generative Image Foundation Models

Auteurs: Dombrowski, Mischa; Reynaud, Hadrien; Baugh, Matthew; Kainz, Bernhard
Publié dans: 2023 IEEE/CVF International Conference on Computer Vision (ICCV), 2023
Éditeur: IEEE
DOI: 10.48550/ARXIV.2212.14306

Trade-Offs in Fine-Tuned Diffusion Models between Accuracy and Interpretability

Auteurs: Dombrowski, Mischa; Reynaud, Hadrien; Müller, Johanna P.; Baugh, Matthew; Kainz, Bernhard
Publié dans: 2024
Éditeur: PKP|PS
DOI: 10.48550/ARXIV.2303.17908

Unsupervised Similarity Learning for Image Registration with Energy-Based Models

Auteurs: Grzech, Daniel; Folgoc, Loïc Le; Azampour, Mohammad Farid; Vlontzos, Athanasios; Glocker, Ben; Navab, Nassir; Schnabel, Julia; Kainz, Bernhard
Publié dans: 2024
Éditeur: Springer, Cham
DOI: 10.1007/978-3-031-73480-9_18

Image Distillation for Safe Data Sharing in Histopathology

Auteurs: Li, Zhe; Kainz, Bernhard
Publié dans: Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention – MICCAI 2024, 2024, ISBN 978-3-031-72116-8
Éditeur: Springer, Cham
DOI: 10.48550/ARXIV.2406.13536

Ensembled Cold-Diffusion Restorations for Unsupervised Anomaly Detection

Auteurs: Sergio Naval Marimont, Vasilis Siomos, Matthew Baugh, Christos Tzelepis, Bernhard Kainz, Giacomo Tarroni
Publié dans: Lecture Notes in Computer Science, Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention – MICCAI 2024, 2024
Éditeur: Springer Nature Switzerland
DOI: 10.48550/ARXIV.2407.06635

Image Generation Diversity Issues and How to Tame Them

Auteurs: Dombrowski, Mischa; Zhang, Weitong; Cechnicka, Sarah; Reynaud, Hadrien; Kainz, Bernhard
Publié dans: 2025 IEEE/CVF Conference on Computer Vision and Pattern Recognition (CVPR), 2025
Éditeur: IEEE
DOI: 10.48550/ARXIV.2411.16171

Uncertainty-Aware Vision Transformers for Medical Image Analysis

Auteurs: Erick, Franciskus Xaverius; Rezaei, Mina; Müller, Johanna Paula; Kainz, Bernhard
Publié dans: 2024
Éditeur: Springer, Cham.
DOI: 10.1007/978-3-031-73158-7_16

Peer reviewed articles (7)

Diff-Def: Diffusion-Generated Deformation Fields for Conditional Atlases

Auteurs: Sophie Starck, Vasiliki Sideri-Lampretsa, Bernhard Kainz, Martin J. Menten, Tamara T. Mueller, Daniel Rueckert
Publié dans: IEEE Transactions on Medical Imaging, 2025, ISSN 0278-0062
Éditeur: Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE)
DOI: 10.48550/ARXIV.2403.16776

Topology Optimization in Medical Image Segmentation with Fast χ Euler Characteristic

Auteurs: Liu Li, Qiang Ma, Cheng Oyang, Johannes C. Paetzold, Daniel Rueckert, Bernhard Kainz
Publié dans: IEEE Transactions on Medical Imaging, 2025, ISSN 0278-0062
Éditeur: Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE)
DOI: 10.48550/ARXIV.2507.23763

AI to Assist in the Fetal Anomaly Ultrasound Scan: A Randomized Controlled Trial

Auteurs: Thomas G. Day, Jacqueline Matthew, Samuel F. Budd, Alfonso Farruggia, Lorenzo Venturini, Robert Wright, Babak Jamshidi, Meekai To, Huazen Ling, Jonathon Lai, Min Yi Tan, Matthew Brown, Gavin Guy, Davide Casagrandi, Anastasija Arechvo, Argyro Syngelaki, David Lloyd, Vita Zidere, Trisha Vigneswaran, Owen Miller, Ranjit Akolekar, Surabhi Nanda, Kypros Nicolaides, Bernhard Kainz, John M. Simpson, Jo V. Hajnal, Reza Razavi
Publié dans: NEJM AI, Numéro 2, 2025, ISSN 2836-9386
Éditeur: Massachusetts Medical Society
DOI: 10.1101/2024.05.23.24307329

Scientific Reports

Auteurs: Zarzor, Mohammad Saeed; Ma, Qiang; Almurey, Median; Kainz, Bernhard; Budday, Silvia
Publié dans: Nature Scientific Reports, Numéro 26103, 2024, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/S41598-024-75952-7

The Developing Human Connectome Project: A fast deep learning-based pipeline for neonatal cortical surface reconstruction

Auteurs: Qiang Ma, Kaili Liang, Liu Li, Saga Masui, Yourong Guo, Chiara Nosarti, Emma C. Robinson, Bernhard Kainz, Daniel Rueckert
Publié dans: Medical Image Analysis, Numéro 100, 2024, ISSN 1361-8415
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.48550/ARXIV.2405.08783

Exploring the role of different cell types on cortical folding in the developing human brain through computational modeling

Auteurs: Mohammad Saeed Zarzor, Qiang Ma, Median Almurey, Bernhard Kainz, Silvia Budday
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 14, 2024, ISSN 2045-2322
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41598-024-75952-7

Medical Image Analysis

Auteurs: Ma, Qiang; Liang, Kaili; Li, Liu; Masui, Saga; Guo, Yourong; Nosarti, Chiara; Robinson, Emma C.; Kainz, Bernhard; Rueckert, Daniel
Publié dans: Medical Image Analysis, 2025, ISSN 1361-8415
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.48550/ARXIV.2405.08783

Book chapters (1)

Causal reasoning in medical imaging

Auteurs: Athanasios Vlontzos, Christine Müller, Bernhard Kainz
Publié dans: Trustworthy AI in Medical Imaging, 2025
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/B978-0-44-323761-4.00029-8