Proteome diversification in evolution

Información del proyecto

PROMISE

Identificador del acuerdo de subvención: 101087830

DOI

10.3030/101087830

Fecha de la firma de la CE 21 Marzo 2023

Fecha de inicio 1 Septiembre 2023

Fecha de finalización 31 Agosto 2028

Financiado con arreglo a

• European Research Council (ERC)

Coste total

€ 1 952 762,50

Aportación de la UE

€ 1 952 762,50

Coordinado por

SORBONNE UNIVERSITE
France

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Resultado final

Data Management Plan (1)

Data Management Plan

Drafting of Data Management Plan

Publicaciones

Peer reviewed articles (9)

Navigating protein–nucleic acid sequence-structure landscapes with deep learning

Autores: Elodie Laine, Sergei Grudinin, Roman Klypa, Isaure Chauvot de Beauchêne
Publicado en: Current Opinion in Structural Biology, Edición 95, 2025, ISSN 0959-440X
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.SBI.2025.103162

Explaining Conformational Diversity in Protein Families through Molecular Motions

Autores: Valentin Lombard; Sergei Grudinin; Elodie Laine
Publicado en: Scientific Data, Edición 11, 2024, ISSN 2052-4463
Editor: Springer Nature
DOI: 10.1101/2024.02.06.578951

Proteome-wide prediction of the functional impact of missense variants with ProteoCast

Autores: Marina Abakarova, Maria Inés Freiberger, Arnaud Liehrmann, Michael Rera, Elodie Laine
Publicado en: Nature Communications, Edición 17, 2026, ISSN 2041-1723
Editor: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41467-026-72140-1

Current Opinion in Structural Biology

Autores: Elodie Laine; Shandar Ahmad
Publicado en: Current Opinion in Structural Biology, 2025, ISSN 0959-440X
Editor: Elsevier
DOI: 10.1016/J.SBI.2025.103184

Journal of Molecular Biology

Autores: Marina Abakarova; Maria Inés Freiberger; Arnaud Liehrmann; Michael Rera; Elodie Laine
Publicado en: Journal of Molecular Biology, 2026, ISSN 0022-2836
Editor: Elsevier
DOI: 10.2139/SSRN.5688657

Proteome-wide Prediction of the Functional Impact of Missense Variants with ProteoCast

Autores: Marina Abakarova; Maria Ines Freiberger; Arnaud Liehrmann; Michael Rera; Elodie Laine
Publicado en: Crossref, 2025, ISSN 2692-8205
Editor: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2025.02.09.637326

SeaMoon: From protein language models to continuous structural heterogeneity

Autores: Valentin Lombard, Dan Timsit, Sergei Grudinin, Elodie Laine
Publicado en: Structure, Edición 33, 2025, ISSN 0969-2126
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.STR.2025.06.010

Toward a comprehensive profiling of alternative splicing proteoform structures, interactions and functions

Autores: Elodie Laine, Maria Inés Freiberger
Publicado en: Current Opinion in Structural Biology, Edición 90, 2025, ISSN 0959-440X
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.SBI.2024.102979

Expert-guided protein Language Models enable accurate and blazingly fast fitness prediction

Autores: Celine Marquet; Julius Schlensok; Marina Abakarova; Burkhard Rost; Elodie Laine
Publicado en: Bioinformatics, Edición 40, 2024, ISSN 1367-4811
Editor: Oxford University Press
DOI: 10.1093/BIOINFORMATICS/BTAE621

Other (1)

Data Management Plan

Conference proceedings (1)

PETIMOT: A Novel Framework for Inferring Protein Motions from Sparse Data Using SE(3)-Equivariant Graph Neural Networks

Autores: Valentin Lombard, Sergei Grudinin, Elodie Laine
Publicado en: LMRL Workshop at ICLR 2025, 2025
Editor: International Conference on Learning Representations
DOI: 10.48550/ARXIV.2504.02839