Proteome diversification in evolution

Informazioni relative al progetto

PROMISE

ID dell’accordo di sovvenzione: 101087830

DOI

10.3030/101087830

Data della firma CE 21 Marzo 2023

Data di avvio 1 Settembre 2023

Data di completamento 31 Agosto 2028

Finanziato da

• European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 1 952 762,50

Contributo UE

€ 1 952 762,50

Coordinato da

SORBONNE UNIVERSITE
France

CORDIS fornisce collegamenti ai risultati finali pubblici e alle pubblicazioni dei progetti ORIZZONTE.

I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Risultati finali

Data Management Plan (1)

Data Management Plan

Drafting of Data Management Plan

Pubblicazioni

Peer reviewed articles (9)

Navigating protein–nucleic acid sequence-structure landscapes with deep learning

Autori: Elodie Laine, Sergei Grudinin, Roman Klypa, Isaure Chauvot de Beauchêne
Pubblicato in: Current Opinion in Structural Biology, Numero 95, 2025, ISSN 0959-440X
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.SBI.2025.103162

Explaining Conformational Diversity in Protein Families through Molecular Motions

Autori: Valentin Lombard; Sergei Grudinin; Elodie Laine
Pubblicato in: Scientific Data, Numero 11, 2024, ISSN 2052-4463
Editore: Springer Nature
DOI: 10.1101/2024.02.06.578951

Proteome-wide prediction of the functional impact of missense variants with ProteoCast

Autori: Marina Abakarova, Maria Inés Freiberger, Arnaud Liehrmann, Michael Rera, Elodie Laine
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 17, 2026, ISSN 2041-1723
Editore: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41467-026-72140-1

Current Opinion in Structural Biology

Autori: Elodie Laine; Shandar Ahmad
Pubblicato in: Current Opinion in Structural Biology, 2025, ISSN 0959-440X
Editore: Elsevier
DOI: 10.1016/J.SBI.2025.103184

Journal of Molecular Biology

Autori: Marina Abakarova; Maria Inés Freiberger; Arnaud Liehrmann; Michael Rera; Elodie Laine
Pubblicato in: Journal of Molecular Biology, 2026, ISSN 0022-2836
Editore: Elsevier
DOI: 10.2139/SSRN.5688657

Proteome-wide Prediction of the Functional Impact of Missense Variants with ProteoCast

Autori: Marina Abakarova; Maria Ines Freiberger; Arnaud Liehrmann; Michael Rera; Elodie Laine
Pubblicato in: Crossref, 2025, ISSN 2692-8205
Editore: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2025.02.09.637326

SeaMoon: From protein language models to continuous structural heterogeneity

Autori: Valentin Lombard, Dan Timsit, Sergei Grudinin, Elodie Laine
Pubblicato in: Structure, Numero 33, 2025, ISSN 0969-2126
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.STR.2025.06.010

Toward a comprehensive profiling of alternative splicing proteoform structures, interactions and functions

Autori: Elodie Laine, Maria Inés Freiberger
Pubblicato in: Current Opinion in Structural Biology, Numero 90, 2025, ISSN 0959-440X
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.SBI.2024.102979

Expert-guided protein Language Models enable accurate and blazingly fast fitness prediction

Autori: Celine Marquet; Julius Schlensok; Marina Abakarova; Burkhard Rost; Elodie Laine
Pubblicato in: Bioinformatics, Numero 40, 2024, ISSN 1367-4811
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/BIOINFORMATICS/BTAE621

Other (1)

Data Management Plan

Conference proceedings (1)

PETIMOT: A Novel Framework for Inferring Protein Motions from Sparse Data Using SE(3)-Equivariant Graph Neural Networks

Autori: Valentin Lombard, Sergei Grudinin, Elodie Laine
Pubblicato in: LMRL Workshop at ICLR 2025, 2025
Editore: International Conference on Learning Representations
DOI: 10.48550/ARXIV.2504.02839