Description du projet
Développer le potentiel de diagnostic de CRISPR-Cas
La technologie CRISPR-Cas facilite l’édition génomique et le diagnostic. Le mécanisme de défense bactérienne de CRISPR-Cas utilise généralement une courte molécule d’ARN qui guide une protéine effectrice Cas (ou un complexe de protéines) vers une séquence cible correspondante. Plusieurs types de CRISPR-Cas ont été caractérisés de manière très détaillée. En ce qui concerne les applications de diagnostic, le système CRISPR-Cas de type III revêt un grand potentiel. Bien qu’une approche de diagnostic à plusieurs étapes récemment mise au point ait suscité beaucoup d’intérêt, il est possible de l’améliorer. Financé par le Conseil européen de la recherche, le projet SCOPE introduit un ARN polymérase thermostable pour harmoniser l’ensemble du processus en une seule étape. Le projet entend fournir une preuve de concept de la faisabilité technique de cette proposition afin de favoriser le diagnostic de la bronchopneumopathie obstructive chronique.
Objectif
Monitoring of human health and the prevention/treatment of (infectious) diseases strongly depend on accurate and efficient detection, identification and tracking of pathogens or biomarkers. Key features of such a diagnostic tool that enable this are speed, accuracy and availability at the point-of-care. Current molecular diagnostic solutions do not meet these requirements due to the fact that they often need to be performed in a centralized fashion. However, the incredible advances in CRISPR-Cas technology in recent years provide an opportunity to change this. By taking advantage of the innate specificity of CRISPR-Cas we have previously developed a highly sensitive and accurate proof-of-concept diagnostic tool with promising results. The potential for implementation is unfortunately impaired by the fact that the workflow comprises of multiple steps that increases hands-on time, room for human error and the undesirable implications this has. To mitigate this, we propose a solution that entails developing a novel approach based on a thermostable RNA polymerase that allows for the condensation of the current workflow into a shorter 1-step protocol. Once such a protocol has been developed, an assay will be developed for one of the causative pathogens of chronic obstructive pulmonary disease (COPD). Technical feasibility of the assay will be demonstrated, in collaboration with an academic hospital, by characterizing the developed assay on relevant clinical samples. This will provide insight into the real-life performance when compared to the current gold standard (PCR) as well as ease-of-use in a relevant context. Furthermore, the feasibility of the value proposition and potential for commercialization will be thoroughly assessed. Not only will this ERC-PoC project shed light on the potential for our improved CRISPR-Cas based diagnostic tool in the context of COPD, a sense of broad applicability in other human Point-of-Care diagnostics applications will be gained.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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Programme(s)
- HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC) Main Programme
Appel à propositions
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2022-POC2
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HORIZON-ERC-POC - HORIZON ERC Proof of Concept GrantsInstitution d’accueil
6708 PB Wageningen
Pays-Bas