Description du projet
Des biomarqueurs pour les hémopathies malignes
La modification épigénétique des résidus de cytosine sur l’ADN témoigne de la modulation de la transcription des gènes. La 5-hydroxyméthylcytosine (5hmC) est la première étape de la levée de la marque répressive de la 5-méthylcytosine (5mC) et pourrait servir de biomarqueur pour la maladie. Financé par le Conseil européen de la recherche, le projet BASE6 s’intéresse au développement d’une puce à ADN destinée à analyser la distribution de la 5hmC dans la santé et la maladie. La plateforme générée sera proposée à un coût réduit et devrait alimenter les travaux visant à découvrir des biomarqueurs du cancer et d’autres maladies. À long terme, la solution BASE6 sera utilisée dans le diagnostic et le suivi des thérapies.
Objectif
5-hydroxymethylcytosine (5hmC) is an oxidized form of 5-methylcytosine (5mC). It is the first step of reversing DNA methylation and an important indicator of dynamic epigenetic changes in genomic DNA. One characteristic of cancerous transformations is dramatic modulation of the epigenomic landscape. Consequently, changes in the distribution of 5hmC have been shown to correlate with a broad range of cancers and is potentially a powerful disease biomarker. Nevertheless, existing methods for mapping 5hmC are complex and expensive thus hindering the translation of 5hmC research into clinical use. This project aims at developing a custom DNA chip for 5hmC that will allow cost-effective and targeted analysis of disease biomarkers. We will use our patented procedure for direct fluorescent labeling of 5hmC in combination with commercially available genome-wide microarrays to create maps of 5hmC distribution in health and disease. These large-scale arrays will be used in the discovery phase to identify cancer biomarkers. In the second phase, only the subset of genomic loci that contain medically significant modulation in 5hmC will be used to design and print a custom microarray containing only the relevant probes. This concept predicts a cost reduction of 10-100 fold which will remove the barriers for large scale research and high volume testing. Disease specific diagnostic chips are attractive products with direct impact on society and economy via promoting more accessible testing and patient management. Our preliminary results indicate that we will be able to offer a universal platform for even the most challenging samples including cell-free DNA analysis from liquid biopsies. We envision it as an enabling technology for 5hmC research, biomarker discovery and companion diagnostics for guiding and monitoring therapy.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. La classification de ce projet a été validée par l’équipe qui en a la charge.
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Programme(s)
- HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC) Main Programme
Appel à propositions
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2022-POC2
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HORIZON-ERC-POC - HORIZON ERC Proof of Concept GrantsInstitution d’accueil
69978 Tel Aviv
Israël