Objetivo
Although multiple regulatory layers have been reported to control stem cell differentiation, including epigenetics, cell signaling and metabolism, we still lack sufficient knowledge on how differentiation processes are connected and coordinated. The Hentze laboratory recently discovered that RNA modulates (riboregulates) the activity of the glycolytic enzyme Enolase 1 (ENO1) and that this interaction is essential for in vitro murine embryonic stem cell differentiation. Additionally, unpublished data from the laboratory show that the glycolytic enzyme pyruvate kinase (PKM) is also riboregulated. However, the role of riboregulation during primary stem cell differentiation remains elusive. Previously, RNA-bound proteomes have either been identified in cultured cells or ex vivo in whole organs. I aim to investigate enzyme-RNA interactions in primary stem cells and differentiated progeny, using the hematopoietic system as a model. First, I will analyze the RNA-binding activity of previously in cellulo profiled enzymes ENO1 and PKM in vivo and ex vivo during hematopoietic stem cell (HSC) differentiation by RNA-proximity ligation assays, profiling of stem cell activity and transcriptome analysis (aim 1). Secondly, I will analyze, identify and comparatively quantify global RNA-protein interactions in HSCs, progenitors and mature blood cells by developing a method to profile in vivo RNA-protein interactions (aim 2). In an interdisciplinary approach, I will pair fluorescence-activated cell sorting with state-of-the-art RNA-protein cross-linking approaches and ultra-low input proteomics analysis. The generated data will help, for the first time, to understand at the analytical and functional level whether and to what degree riboregulation of enzymes represents a regulatory paradigm operational in mammalian cells, with a focus on hematopoietic stem cell differentiation.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas proteómica
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ARN
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas enzima
- ciencias naturales ciencias biológicas genética epigenética
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) HORIZON-MSCA-2022-PF-01
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
69117 Heidelberg
Alemania
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.