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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Revealing the architecture of replicated human chromosomes by sister-chromatid-sensitive fluorescence in situ hybridisation

Objectif

The extremely long DNA molecules encoding complex genomes of higher eukaryotes must be organised inside the tiny volume of cells so that the genetic information can be read, maintained, and propagated across cell generations. Genomic DNA is folded into loops such that contacts between distant DNA elements can mediate transcriptional regulation or assembly of mechanically stiff mitotic chromosomes. Following DNA replication, each chromosome contains two DNA molecules, which interact with each other to support homology-directed repair during interphase and DNA compaction during mitosis.
Advances in sequencing technology and super-resolution microscopy have revealed the 3D structure of chromosomes with unprecedented resolution, but conventional methods cannot distinguish between the identical sequence present in replicated sister-chromatids. The Gerlich lab has recently developed a new sequencing-based technique termed sister-chromatid-sensitive (scs)Hi-C, which allows the discrimination of intra- from inter-molecular contacts in replicated chromosomes. However, scsHi-C can only inform on interaction probabilities and does not reveal the actual 3D structure in single cells.
Therefore, the aim of my proposed project is to establish a sister-chromatid-sensitive fluorescence in situ hybridisation (scsFISH) method for the highly multiplexed and automated detection of the 3D architecture of replicated genomes within individual cells. The ring-shaped cohesin complex is a key regulator of chromosome structure by forming loops within DNA molecules and by linking sister-chromatids. By depleting cohesin core subunits/regulators, I will use scsFISH to understand how cohesin structures replicated chromosomes. I will further investigate how sister-chromatid conformation influences the efficiency of homology-directed repair at double-strand breaks. My project will hence provide insights into the organisation of replicated genomes, with important implications for genomic integrity.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2022-PF-01

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Coordinateur

INSTITUT FUER MOLEKULARE BIOTECHNOLOGIE GMBH
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 199 440,96
Adresse
DR BOHRGASSE 3
1030 WIEN
Autriche

Voir sur la carte

Région
Ostösterreich Wien Wien
Type d’activité
Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments)
Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

Aucune donnée
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