Descripción del proyecto
Análisis de alta resolución de la agregación de proteínas
En situaciones patológicas, las proteínas pueden plegarse mal, dando lugar a agregados que alteran las funciones celulares y provocando enfermedades. La agregación de α sinucleína (αSyn) es una característica distintiva de la enfermedad de Parkinson y su deposición en los cuerpos de Lewy conlleva disfunción neuronal. Nuevas pruebas indican que la αSyn sufre una separación de fases líquido-líquido, un proceso reversible en el que la solución de proteína se separa en fases densa y diluida. Las elevadas concentraciones en la fase densa favorecen la agregación de αSyn en fibrillas amiloides. El proyecto IDP Assembly, que cuenta con el apoyo de las acciones Marie Skłodowska-Curie, tiene como objetivo desarrollar un método novedoso para el análisis de alta resolución de la agregación de αSyn, lo cual allanará el camino para intervenciones novedosas.
Objetivo
Protein aggregation hallmarks several neurodegenerative diseases, including Alzheimer's and Parkinson's. In Parkinson's, aggregation of the intrinsically disordered protein (IDP) alpha-synuclein (Syn) leads to its intracellular deposition into Lewy bodies, which causes neuronal dysfunction. Recently it was discovered that Syn can undergo liquid-liquid phase separation (LLPS), whereby a protein solution spontaneously separates into a dense and a dilute phase. This process is initially reversible, but the high concentrations of the dense phase strongly favor the aggregation of Syn into amyloid fibrils. Structural characterization of the transient Syn conformations during LLPS and amyloid formation is therefore crucial for understanding the disease pathology on the molecular level. This project aims to develop a novel experimental concept for the high-resolution conformational analysis of Syn assembly and aggregation using scanning mutagenesis combined with cutting-edge high-throughput biophysical techniques and computational analysis. The core idea is to apply multiple biophysical assays to quantify the effects of hundreds of Syn mutations on the kinetics and thermodynamics of LLPS and amyloid formation. The resulting multidimensional experimental datasets will be processed within the phi-value analysis framework originally derived for protein folding and combined with molecular dynamics simulations. The integrated methodology will allow gaining important structural and mechanistic insights into the early-aggregation events of Syn at a single amino acid level of resolution. The project includes extensive training to enhance my scientific skills in modern experimental and computational methods. The proposed strategy is widely applicable to other IDP systems that can undergo LLPS and aggregation and paves the way for the design of rational and precisely tailored intervention strategies against the diseases associated with these phenomena.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véase: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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Palabras clave
Programa(s)
- HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA) Main Programme
Convocatoria de propuestas
(se abrirá en una nueva ventana) HORIZON-MSCA-2022-PF-01
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HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European FellowshipsCoordinador
2800 Kongens Lyngby
Dinamarca