Description du projet
Analyse haute résolution de l’agrégation des protéines
Dans certains contextes pathologiques, les protéines peuvent être mal repliées et former des agrégats qui perturbent les fonctions cellulaires et provoquent des maladies. L’agrégation de l’alpha-synucléine (αSyn) est une caractéristique de la maladie de Parkinson et son dépôt en corps de Lewy induit un dysfonctionnement neuronal. De nouvelles données suggèrent que l’αSyn subit une séparation de phase liquide-liquide, un processus réversible au cours duquel la solution protéique se sépare en deux phases, l’une dense et l’autre diluée. De hautes concentrations dans la phase dense favorisent l’agrégation de l’αSyn en fibrilles amyloïdes. Avec le soutien du programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet IDP Assembly entend développer une nouvelle méthode d’analyse haute résolution de l’agrégation de l’αSyn, ouvrant la voie à des interventions innovantes.
Objectif
Protein aggregation hallmarks several neurodegenerative diseases, including Alzheimer's and Parkinson's. In Parkinson's, aggregation of the intrinsically disordered protein (IDP) alpha-synuclein (Syn) leads to its intracellular deposition into Lewy bodies, which causes neuronal dysfunction. Recently it was discovered that Syn can undergo liquid-liquid phase separation (LLPS), whereby a protein solution spontaneously separates into a dense and a dilute phase. This process is initially reversible, but the high concentrations of the dense phase strongly favor the aggregation of Syn into amyloid fibrils. Structural characterization of the transient Syn conformations during LLPS and amyloid formation is therefore crucial for understanding the disease pathology on the molecular level. This project aims to develop a novel experimental concept for the high-resolution conformational analysis of Syn assembly and aggregation using scanning mutagenesis combined with cutting-edge high-throughput biophysical techniques and computational analysis. The core idea is to apply multiple biophysical assays to quantify the effects of hundreds of Syn mutations on the kinetics and thermodynamics of LLPS and amyloid formation. The resulting multidimensional experimental datasets will be processed within the phi-value analysis framework originally derived for protein folding and combined with molecular dynamics simulations. The integrated methodology will allow gaining important structural and mechanistic insights into the early-aggregation events of Syn at a single amino acid level of resolution. The project includes extensive training to enhance my scientific skills in modern experimental and computational methods. The proposed strategy is widely applicable to other IDP systems that can undergo LLPS and aggregation and paves the way for the design of rational and precisely tailored intervention strategies against the diseases associated with these phenomena.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale neurologie démence alzheimer
- sciences naturelles sciences physiques thermodynamique
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences biologiques génétique mutation
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale neurologie parkinson
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2022-PF-01
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
2800 KONGENS LYNGBY
Danemark
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.