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Assessing the risks of plant pathogen resistance evolution for the success of microbe-mediated biocontrol

Projektbeschreibung

Lösungen für mikrobielle biologische Bekämpfungsmittel und Resistenz von Pflanzen

Biologische Bekämpfungsmittel sind eine wirksame und nachhaltige Alternative zu herkömmlichen Pestiziden. Die Bakterien bei den Mitteln produzieren antimikrobielle Verbindungen, doch es ist unklar, ob Resistenzen aufkommen können. Finanziert über die Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen wird im Projekt RhizoEvo die Resistenz gegen Schädlinge der Tomatenpflanze mit spezifischen Bakterien biologischer Bekämpfungsmittel erforscht. Die Forschenden stellen ein System auf, um die bakterielle Anpassung über mehrere Pflanzengenerationen hinweg aufzuzeichnen. Dabei kommen verschiedene Analysemethoden aus der Mikrobiologie, Genomik und Metabolomik zum Einsatz. Die Ergebnisse werden grundlegende Erkenntnisse zur langfristigen Wirkung biologischer Bekämpfungsmittel sein, mit denen die Risiken der Pathogenresistenz bewertet und das Wissen zur mikrobiellen Evolution in der Landwirtschaft ausgeweitet werden können.

Ziel

Microbe-mediated plant pathogen biocontrol has been suggested as an environmentally friendly alternative for agrochemicals to increase global food production. While biocontrol bacteria have been shown to suppress the growth of plant pathogenic bacteria via the production of antimicrobials, it remains unclear whether pathogens can escape this by evolving resistance. The main aim of this proposal is to experimentally test whether plant pathogenic Ralstonia solanacearum bacterium can evolve resistant to Pseudomonas protegens biocontrol bacterium in the tomato plant rhizosphere. I will also test if pathogen resistance evolution results in co-evolution and increased antimicrobial activity of the biocontrol bacterium, and if microbial adaptations will affect how both bacteria interact with the tomato plant, potentially shifting plant-microbe interactions along the parasitism-mutualism continuum (virulence vs. plant growth-promotion). To achieve this, I will learn to use a novel experimental-evolution system that allows direct tracking of bacterial adaptation in the rhizosphere of tomatoes over successive plant generations. Training will also be provided to quantify bacterial adaptation using a combination of microbiological assays, genomics, metabolomics and plant assays. The proposed work will help to assess the potential risks of plant pathogen resistance evolution for the long-term efficiency of microbe-mediated biocontrol. It will also improve fundamental understanding of the rapid microbial evolution in an agriculturally relevant model system and help identify potentially novel antimicrobial compounds for future crop protection.

Koordinator

HELSINGIN YLIOPISTO
Netto-EU-Beitrag
€ 215 534,40
Adresse
YLIOPISTONKATU 3
00014 Helsingin Yliopisto
Finnland

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Region
Manner-Suomi Helsinki-Uusimaa Helsinki-Uusimaa
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
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Gesamtkosten
Keine Daten