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Resolving temporal immune responses of Arabidopsis roots to infection by Fusarium oxysporum at the single-cell level

Description du projet

Les réponses des plantes aux agents pathogènes sous la loupe

Les plantes utilisent des défenses physiques et autres qui leur sont propres pour lutter contre les invasions d’agents pathogènes et les maladies. Il est absolument indispensable de comprendre ces processus si l’on veut créer des cultures agricoles plus résistantes. Financé par le programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet SC-Foxy a pour ambition de générer un modèle plus représentatif de l’interaction plante-pathogène en utilisant la plante Arabidopsis thaliana et une espèce fongique. L’idée est d’étudier les réponses des cellules végétales individuelles aux souches nuisibles ou bénéfiques du champignon en utilisant une nouvelle technique de marquage des cellules. Les résultats du projet amélioreront notre compréhension actuelle des réponses immunitaires des plantes et faciliteront le développement de nouvelles interventions dans l’agriculture.

Objectif

Pathogen-caused diseases represent one of the biggest problems in agriculture. A detailed mechanistic understanding of plant defenses against pathogenic invasion and disease progression is therefore a vital research topic, forming the foundation for the creation of more resistant crop varieties. However, at present, most studies aimed at this utilize omics approaches or mutant analyses, which lack resolution and only allow limited understanding of plant-pathogen interactions at the single-cell level. Thus, our current models of plant-pathogen interaction do not include strictly local or temporal responses. The aim of this proposal is to address this with a pathosystem consisting of the model plant Arabidopsis thaliana and strains of Fusarium oxysporum, a destructive fungal pathogen of several food crops. A unique near-native imaging setup, enabling the simultaneous study of growth and infection of plant and fungus with single-cell resolution, will be used. The work in this proposal will probe the responses of individual plant cells to both pathogenic and beneficial F. oxysporum strains, in a native tissue context from the onset of invasion to full disease development. This will generate novel insights into cellular mechanisms employed by plants to fight off pathogenic invaders, while accommodating beneficial endophytes. By using a novel in vivo cell-labeling technique, exploiting the fungal avirulence effector secretion system, a single-cell transcriptome atlas exclusively of cells undergoing acute colonization will be generated. Moreover, as root barriers represent a physical hindrance for pathogen invasion, mutants affected in physical defenses will be tested. Combined, this proposal will expand our current models of immune responses to include specific cells, regions or tissues, and temporal aspects with high resolution. Such knowledge is important to develop next-generation agricultural tools and will be applicable to combat current and arising diseases.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. La classification de ce projet a été validée par l’équipe qui en a la charge.

Coordinateur

MAX-PLANCK-GESELLSCHAFT ZUR FORDERUNG DER WISSENSCHAFTEN EV
Contribution nette de l'UE
€ 189 687,36
Adresse
HOFGARTENSTRASSE 8
80539 Munchen
Allemagne

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Région
Bayern Oberbayern München, Kreisfreie Stadt
Type d’activité
Research Organisations
Liens
Coût total
Aucune donnée