Objectif
The human genome is pervasively transcribed, producing RNA from ~ 80-90% of its DNA, yet only a small fraction of transcripts result in the generation of functional RNAs. Instead, the majority of transcription initiation events are prematurely terminated and the resulting RNA is targeted by decay pathways. How cells determine which RNAs to degrade vs. which to prepare for functional tasks, is a central question. Interestingly, new data from my host laboratory, that motivates this application, suggest that non-productive transcription events are correlated with low transcription initiation levels; i.e. lowly transcribed RNAs appear to be more susceptible to early termination and ensuing rapid degradation. Transcription termination in these instances is conducted by either Integrator (INT) complex or components interacting with ARS2 transcription termination factor. In the present project, I will investigate the mechanisms underlying this relationship, which could possibly rationalize how cells keep their spurious transcription under control. Considering the association of INT and ARS2 mutations with cancer and neurological diseases, my results might also pave the way for therapeutic interventions.
Previous approaches utilizing targeted transcription repression/activation by CRISPRi/a approach are based on absolute On/Off transcription from the selected loci without the ability to fine-tune the transcription at a predicted level. Here, I will utilise newly reported mismatch guide RNA/CRISPR-dCas9 to manipulate initiation to defined levels and hereby establish a tuneable system to assay the fate of RNAs expressed from weaker vs. stronger promoters. I will then exploit this system to address the molecular mechanism, dictating genome control based on transcription initiation levels.
The findings of my project will be of interest to many disciplines of the scientific community in that it might help explain how genome expression is sorted at a higher order level.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences biologiques génétique mutation
- sciences médicales et de la santé médecine clinique oncologie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2022-PF-01
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
8000 Aarhus C
Danemark
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.