Ziel
The human genome is pervasively transcribed, producing RNA from ~ 80-90% of its DNA, yet only a small fraction of transcripts result in the generation of functional RNAs. Instead, the majority of transcription initiation events are prematurely terminated and the resulting RNA is targeted by decay pathways. How cells determine which RNAs to degrade vs. which to prepare for functional tasks, is a central question. Interestingly, new data from my host laboratory, that motivates this application, suggest that non-productive transcription events are correlated with low transcription initiation levels; i.e. lowly transcribed RNAs appear to be more susceptible to early termination and ensuing rapid degradation. Transcription termination in these instances is conducted by either Integrator (INT) complex or components interacting with ARS2 transcription termination factor. In the present project, I will investigate the mechanisms underlying this relationship, which could possibly rationalize how cells keep their spurious transcription under control. Considering the association of INT and ARS2 mutations with cancer and neurological diseases, my results might also pave the way for therapeutic interventions.
Previous approaches utilizing targeted transcription repression/activation by CRISPRi/a approach are based on absolute On/Off transcription from the selected loci without the ability to fine-tune the transcription at a predicted level. Here, I will utilise newly reported mismatch guide RNA/CRISPR-dCas9 to manipulate initiation to defined levels and hereby establish a tuneable system to assay the fate of RNAs expressed from weaker vs. stronger promoters. I will then exploit this system to address the molecular mechanism, dictating genome control based on transcription initiation levels.
The findings of my project will be of interest to many disciplines of the scientific community in that it might help explain how genome expression is sorted at a higher order level.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik DNS
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Mutation
- Medizin- und Gesundheitswissenschaften Klinische Medizin Onkologie
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik RNS
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Genom
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
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Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2022-PF-01
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
8000 Aarhus C
Dänemark
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.