Obiettivo
The human genome is pervasively transcribed, producing RNA from ~ 80-90% of its DNA, yet only a small fraction of transcripts result in the generation of functional RNAs. Instead, the majority of transcription initiation events are prematurely terminated and the resulting RNA is targeted by decay pathways. How cells determine which RNAs to degrade vs. which to prepare for functional tasks, is a central question. Interestingly, new data from my host laboratory, that motivates this application, suggest that non-productive transcription events are correlated with low transcription initiation levels; i.e. lowly transcribed RNAs appear to be more susceptible to early termination and ensuing rapid degradation. Transcription termination in these instances is conducted by either Integrator (INT) complex or components interacting with ARS2 transcription termination factor. In the present project, I will investigate the mechanisms underlying this relationship, which could possibly rationalize how cells keep their spurious transcription under control. Considering the association of INT and ARS2 mutations with cancer and neurological diseases, my results might also pave the way for therapeutic interventions.
Previous approaches utilizing targeted transcription repression/activation by CRISPRi/a approach are based on absolute On/Off transcription from the selected loci without the ability to fine-tune the transcription at a predicted level. Here, I will utilise newly reported mismatch guide RNA/CRISPR-dCas9 to manipulate initiation to defined levels and hereby establish a tuneable system to assay the fate of RNAs expressed from weaker vs. stronger promoters. I will then exploit this system to address the molecular mechanism, dictating genome control based on transcription initiation levels.
The findings of my project will be of interest to many disciplines of the scientific community in that it might help explain how genome expression is sorted at a higher order level.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche genetica DNA
- scienze naturali scienze biologiche genetica mutazione
- scienze mediche e della salute medicina clinica oncologia
- scienze naturali scienze biologiche genetica RNA
- scienze naturali scienze biologiche genetica genomi
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2022-PF-01
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
8000 Aarhus C
Danimarca
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.