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Impact of soil microbiodiversity on the development of wild mammal gut biota and immune function

Description du projet

Mettre en lumière les racines des maladies de civilisation

Une menace silencieuse plane sur notre monde modernisé: les maladies de civilisation (liées au mode de vie) telles que l’asthme et les allergies, alimentées par un équilibre perturbé entre les microbes de l’environnement et ceux associés à l’hôte. L’hypothèse de la biodiversité établit un lien direct entre ce déséquilibre microbien et le dysfonctionnement immunitaire. Le projet SOIL2GUT, soutenu par le programme Actions Marie Skłodowska-Curie, lance une initiative transformatrice, utilisant le modèle du campagnol roussâtre pour déterminer si l’exposition aux microbes naturels du sol au cours du développement peut remodeler les résultats de santé et atténuer le risque de maladies liées à l’immunité. Ce projet révolutionnaire ne se contente pas de sonder les racines de nos problèmes de santé, il ouvre également la voie à des solutions innovantes dans un monde qui s’urbanise rapidement.

Objectif

The biodiversity hypothesis asserts there is a link between the diversity of environmental and host-associated microbes and civilization diseases', such as asthma and allergies, the result of immune dysfunction and chronic inflammation. Using a well-studied rodent model, the bank vole, SOIL2GUT will test for the first time whether exposure to natural communities of soil microbes during development can improve individual health by promoting microbiota function at the host-microbiota interface (ileum and colon mucous layers) and reduce the risk of immune-related diseases. SOIL2GUT will take advantage of tissue samples generated by an ongoing intervention experiment, promoting the 3Rs policy, but also providing a unique opportunity for omics integration (metataxonomics + MTX). Innovatively, this project will focus on the function of gut flora (not merely taxonomical characterization), in both bacteria and fungi (the latter is particularly unusual), using recent developments in metatranscriptonomics (MTX) to explore functional activity, and combining metadata and metatranscriptomes in statistical models to identify critical factors determining health. Since 68% of the human population will be urbanized by 2050, SOIL2GUT will contribute significantly to the WHO OneHealth framework. This project will also provide data that can be used to plan urban greenspaces, enhance rewilding interventions and improve domestic and zoo animal wellbeing. The researcher will build on his previous experiences and solid publications as a PhD/postdoc, receiving advanced personalized training in bioinformatics and soft skills, including writing grant applications for expanding to other tissues (lung, skin), and rendering him highly employable. In exchange, the researcher will bring methods for measuring individual health and immune gene expression to the hosting lab, among others. A synergy of expertise in microbiota research is envisaged, leading to future collaborative endeavors.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

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Coordinateur

FONDAZIONE EDMUND MACH
Contribution nette de l'UE
€ 172 750,08
Adresse
VIA EDMONDO MACH 1
38098 San Michele All'Adige
Italie

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Région
Nord-Est Provincia Autonoma di Trento Trento
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Liens
Coût total
Aucune donnée