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Impact of soil microbiodiversity on the development of wild mammal gut biota and immune function

Projektbeschreibung

Den Ursprüngen der Zivilisationskrankheiten auf der Spur

In unserer modernisierten Welt lauert eine stille Bedrohung – Zivilisationskrankheiten wie Asthma und Allergien, die durch ein gestörtes Gleichgewicht von Umwelt- und wirtsassoziierten Mikroben ausgelöst werden. Im Rahmen der Biodiversitätshypothese wird ein direkter Zusammenhang zwischen diesem mikrobiellen Ungleichgewicht und der Störung des Immunsystems hergestellt. Mit Unterstützung der Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen leistet das Team im Projekt SOIL2GUT Pionierarbeit. Es nutzt das Modell der Wühlmaus, um zu erforschen, ob die Exposition gegenüber natürlichen Bodenmikroben während der Entwicklung den Gesundheitszustand verändern und das Risiko von Immunerkrankungen mindern kann. Über dieses bahnbrechende Projekt werden nicht nur die Ursprünge unserer gesundheitlichen Herausforderungen erforscht, sondern es ebnet auch den Weg für innovative Lösungen in einer sich rasch urbanisierenden Welt.

Ziel

The biodiversity hypothesis asserts there is a link between the diversity of environmental and host-associated microbes and civilization diseases', such as asthma and allergies, the result of immune dysfunction and chronic inflammation. Using a well-studied rodent model, the bank vole, SOIL2GUT will test for the first time whether exposure to natural communities of soil microbes during development can improve individual health by promoting microbiota function at the host-microbiota interface (ileum and colon mucous layers) and reduce the risk of immune-related diseases. SOIL2GUT will take advantage of tissue samples generated by an ongoing intervention experiment, promoting the 3Rs policy, but also providing a unique opportunity for omics integration (metataxonomics + MTX). Innovatively, this project will focus on the function of gut flora (not merely taxonomical characterization), in both bacteria and fungi (the latter is particularly unusual), using recent developments in metatranscriptonomics (MTX) to explore functional activity, and combining metadata and metatranscriptomes in statistical models to identify critical factors determining health. Since 68% of the human population will be urbanized by 2050, SOIL2GUT will contribute significantly to the WHO OneHealth framework. This project will also provide data that can be used to plan urban greenspaces, enhance rewilding interventions and improve domestic and zoo animal wellbeing. The researcher will build on his previous experiences and solid publications as a PhD/postdoc, receiving advanced personalized training in bioinformatics and soft skills, including writing grant applications for expanding to other tissues (lung, skin), and rendering him highly employable. In exchange, the researcher will bring methods for measuring individual health and immune gene expression to the hosting lab, among others. A synergy of expertise in microbiota research is envisaged, leading to future collaborative endeavors.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

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Koordinator

FONDAZIONE EDMUND MACH
Netto-EU-Beitrag
€ 172 750,08
Adresse
VIA EDMONDO MACH 1
38098 San Michele All'Adige
Italien

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Region
Nord-Est Provincia Autonoma di Trento Trento
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten
Keine Daten