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Epigenome establishment and maintenance of the inactive X chromosome in response to DNA double-strand breaks in mammalian cells

Descripción del proyecto

Comprender la relación entre la cromatina y la reparación del ADN

En función de sus necesidades, una célula puede modificar la estructura de su cromatina, pasando de una forma condensada e inactiva a un estado menos condensado y activo, y viceversa. Esta característica reversible de la cromatina determina la regulación génica y la diferenciación celular. En el proyecto XICUT, financiado por las acciones Marie Skłodowska-Curie, se pretende examinar la respuesta al daño en el ADN en la cromatina y cómo esto afecta a la reparación del ADN. Sus investigadores se centrarán en el cromosoma X inactivo de las hembras de mamíferos para estudiar cómo reacciona su estado de cromatina a las roturas de doble hélice del ADN. El trabajo aportará conocimientos relevantes sobre los mecanismos de reparación del ADN y la dinámica de la cromatina.

Objetivo

The DNA damage response takes place on a chromatin substrate and triggers profound chromatin alterations. Chromatin states vary substantially between genomic regions, driving distinct gene expression profiles and also different DNA damage repair responses. One striking example is the heterochromatinization of an entire chromosome, the inactive X chromosome in female mammals, that is silenced during embryonic development by facultative heterochromatin formation. How the facultative heterochromatin state of the inactive X responds to DNA damage and impacts DNA repair is poorly understood. My research project aims at identifying chromatin changes that accompany the repair of the most cytotoxic form of DNA damage, DNA double-strand breaks (DSBs), in facultative heterochromatin and the mechanisms that ensure the establishment and maintenance of the inactive X chromosome in response to DNA damage in mammalian cells. To generate DSBs, I use the CRISPR/Cas9 technology that allows sequence-specific targeting of the Cas9 nuclease. Thanks to available bioinformatic tools, I can discriminate between active and inactive X chromosomes, analyze the genomic instability profiles induced around the break sites and decipher the repair pathway involved. In parallel, I will profile the chromatin marks associated with the inactive X chromosome in the vicinity of DSBs to assess the impact of DNA damage and repair on heterochromatin maintenance. Moreover, I will test the hypothesis that the high level of replicative stress-induced breaks in embryonic stem cells could drive heterochromatin establishment and thus skew the choice of the inactive X chromosome. For this, I will study the impact of generating DSBs on one X chromosome of mouse stem cells on their differentiation potential and their propension to inactivate the damaged X chromosome. Together, this work should shed light on the interplay between the DSB response and facultative heterochromatin states.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Palabras clave

Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).

Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Ver todos los proyectos financiados en el marco de este régimen de financiación

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

(se abrirá en una nueva ventana) HORIZON-MSCA-2022-PF-01

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Coordinador

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
Aportación neta de la UEn

Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.

€ 211 754,88
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

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Socios (1)

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