Descrizione del progetto
Comprendere il legame tra cromatina e riparazione del DNA
A seconda delle sue esigenze, una cellula può modificare la struttura della cromatina da una forma condensata e inattiva a uno stato meno condensato e attivo, e viceversa. Questa natura reversibile della cromatina modella la regolazione genica e la differenziazione cellulare. Il progetto XICUT, finanziato dal programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, si propone di studiare la risposta ai danni al DNA all’interno della cromatina e come questa influisca sulla riparazione del DNA. I ricercatori si concentreranno sul cromosoma X inattivo nei mammiferi femmina, esplorando come il suo stato cromatinico reagisce alle rotture del doppio filamento di DNA. Il lavoro fornirà importanti approfondimenti sui meccanismi di riparazione e sulla dinamica della cromatina.
Obiettivo
The DNA damage response takes place on a chromatin substrate and triggers profound chromatin alterations. Chromatin states vary substantially between genomic regions, driving distinct gene expression profiles and also different DNA damage repair responses. One striking example is the heterochromatinization of an entire chromosome, the inactive X chromosome in female mammals, that is silenced during embryonic development by facultative heterochromatin formation. How the facultative heterochromatin state of the inactive X responds to DNA damage and impacts DNA repair is poorly understood. My research project aims at identifying chromatin changes that accompany the repair of the most cytotoxic form of DNA damage, DNA double-strand breaks (DSBs), in facultative heterochromatin and the mechanisms that ensure the establishment and maintenance of the inactive X chromosome in response to DNA damage in mammalian cells. To generate DSBs, I use the CRISPR/Cas9 technology that allows sequence-specific targeting of the Cas9 nuclease. Thanks to available bioinformatic tools, I can discriminate between active and inactive X chromosomes, analyze the genomic instability profiles induced around the break sites and decipher the repair pathway involved. In parallel, I will profile the chromatin marks associated with the inactive X chromosome in the vicinity of DSBs to assess the impact of DNA damage and repair on heterochromatin maintenance. Moreover, I will test the hypothesis that the high level of replicative stress-induced breaks in embryonic stem cells could drive heterochromatin establishment and thus skew the choice of the inactive X chromosome. For this, I will study the impact of generating DSBs on one X chromosome of mouse stem cells on their differentiation potential and their propension to inactivate the damaged X chromosome. Together, this work should shed light on the interplay between the DSB response and facultative heterochromatin states.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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- scienze naturaliscienze biologichegeneticaDNA
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- scienze naturaliscienze biologichegeneticacromosomi
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Parole chiave
Programma(i)
- HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA) Main Programme
Invito a presentare proposte
(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2022-PF-01
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HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European FellowshipsCoordinatore
75794 Paris
Francia