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Epigenome establishment and maintenance of the inactive X chromosome in response to DNA double-strand breaks in mammalian cells

Descrizione del progetto

Comprendere il legame tra cromatina e riparazione del DNA

A seconda delle sue esigenze, una cellula può modificare la struttura della cromatina da una forma condensata e inattiva a uno stato meno condensato e attivo, e viceversa. Questa natura reversibile della cromatina modella la regolazione genica e la differenziazione cellulare. Il progetto XICUT, finanziato dal programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, si propone di studiare la risposta ai danni al DNA all’interno della cromatina e come questa influisca sulla riparazione del DNA. I ricercatori si concentreranno sul cromosoma X inattivo nei mammiferi femmina, esplorando come il suo stato cromatinico reagisce alle rotture del doppio filamento di DNA. Il lavoro fornirà importanti approfondimenti sui meccanismi di riparazione e sulla dinamica della cromatina.

Obiettivo

The DNA damage response takes place on a chromatin substrate and triggers profound chromatin alterations. Chromatin states vary substantially between genomic regions, driving distinct gene expression profiles and also different DNA damage repair responses. One striking example is the heterochromatinization of an entire chromosome, the inactive X chromosome in female mammals, that is silenced during embryonic development by facultative heterochromatin formation. How the facultative heterochromatin state of the inactive X responds to DNA damage and impacts DNA repair is poorly understood. My research project aims at identifying chromatin changes that accompany the repair of the most cytotoxic form of DNA damage, DNA double-strand breaks (DSBs), in facultative heterochromatin and the mechanisms that ensure the establishment and maintenance of the inactive X chromosome in response to DNA damage in mammalian cells. To generate DSBs, I use the CRISPR/Cas9 technology that allows sequence-specific targeting of the Cas9 nuclease. Thanks to available bioinformatic tools, I can discriminate between active and inactive X chromosomes, analyze the genomic instability profiles induced around the break sites and decipher the repair pathway involved. In parallel, I will profile the chromatin marks associated with the inactive X chromosome in the vicinity of DSBs to assess the impact of DNA damage and repair on heterochromatin maintenance. Moreover, I will test the hypothesis that the high level of replicative stress-induced breaks in embryonic stem cells could drive heterochromatin establishment and thus skew the choice of the inactive X chromosome. For this, I will study the impact of generating DSBs on one X chromosome of mouse stem cells on their differentiation potential and their propension to inactivate the damaged X chromosome. Together, this work should shed light on the interplay between the DSB response and facultative heterochromatin states.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2022-PF-01

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 211 754,88
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato

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