Descrizione del progetto
I segreti del caricamento degli sRNA e del movimento nelle piante
I piccoli RNA (sRNA) sono regolatori fondamentali dell’espressione genica negli organismi eucarioti che governano processi cruciali, dallo sviluppo all’integrità del genoma. Nelle piante questi sRNA, che si suddividono in piccoli RNA interferenti (siRNA) e microRNA (miRNA), richiedono proteine ARGONAUTE (AGO) per realizzare un preciso bersagliamento genico. Tuttavia, la complessità insita nel processo di caricamento degli sRNA in AGO1 e il suo impatto sul movimento intra- e inter-cellulare rimangono avvolti nel mistero. Con il sostegno del programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, il progetto LoAGOding si propone di svelare questi enigmi combinando tecniche all’avanguardia, quali l’analisi di sequenziamento profondo, la microscopia a super-risoluzione e la biochimica dell’RNA. Comprendendo i meccanismi di caricamento degli sRNA e i percorsi di movimento, questo progetto mira a rivoluzionare la produttività delle colture, a migliorare la tolleranza agli stress e, in ultima analisi, a garantire l’eccellenza europea in questo campo.
Obiettivo
Small RNAs (sRNA) are essential regulators of gene expression, controlling development and preserving genome integrity, all across eukaryotic organisms. To execute their final functions, sRNA are loaded into an ARGONAUTE (AGO) protein to guide through sequence complementarity the regulation of target genes. In plants, sRNAs are divided into small interfering RNA (siRNA) and microRNA (miRNA), and both can be loaded into AGO1 for cell-autonomous action, or move out of the cell to act non-cell autonomously. This proposal outlines a series of complementary experiments to mechanistically study the loading of sRNA into AGO1 and to understand how it contributes to the intra- and inter-cellular movement of sRNA in plants. By combining cell biology, RNA biochemistry, deep-sequencing analysis, nuclear fractionation methods, micrografting and super-resolution microscopy, this project aims at: i) characterize the nuclear and cytoplasmic sRNA loading complexes (LCs), ii) decipher the connection between sRNA biogenesis and LCs and, iii) determine how sRNA loading could affect the sRNA movement. The results obtained will advance the state of the art in plants in our understanding of AGO1 loading mechanism, the execution of the AGO1 function and sRNA movement. Studying these pathways goes beyond mere mechanistic knowledge, as sRNA movement is being exploited to modulate plant and pathogen gene expression towards improving crop productivity and enhancing stress/pathogen tolerance, a booming strategy known as Spray-induced gene silencing. Altogether, this project is expected to create a wealth of original information, providing a meaningful contribution to European excellence and competitiveness in the field.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
- scienze naturaliscienze fisicheotticamicroscopiamicroscopia a super risoluzione
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Parole chiave
Programma(i)
- HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA) Main Programme
Invito a presentare proposte
(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2022-PF-01
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HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF -Coordinatore
08193 Cerdanyola Del Valles
Spagna