Projektbeschreibung
Entschlüsselung der Geheimnisse des 3D-Genoms
Die Entschlüsselung der Geheimnisse der Genexpression hängt vom Verständnis des komplexen Zusammenspiels innerhalb der dreidimensionalen (3D) Chromatinstrukturen unseres Genoms ab. Die Mechanismen, die diesen 3D-Chromatin-Interaktionen und ihrem Einfluss auf die Genexpression zugrunde liegen, sind nach wie vor ungeklärt. Die Herausforderung besteht darin, dass es an Instrumenten fehlt, die eine zeitliche Kontrolle über regulatorische Proteine und eine hochauflösende Messung von 3D-Chromatin-Interaktionen ermöglichen. Vor diesem Hintergrund zielt das vom Europäischen Forschungsrat finanzierte Projekt 3D-REG darauf ab, neue Instrumente zu entwickeln, um die molekularen Mechanismen, die das Genom bei der zellulären Differenzierung formen, mit hoher zeitlicher und räumlicher Auflösung zu entschlüsseln.
Ziel
The orchestration of precise gene expression patterns during differentiation and development is dependent on the cis-regulatory elements of the genome, which interact and communicate in three-dimensional (3D) chromatin structures. It is not well understood how these interactions are formed and influence gene expression. Our ability to identify the molecular mechanisms involved is hampered by a lack of tools that provide control over the function of regulatory proteins with high temporal precision and that measure 3D chromatin interactions at high resolution. In this project, we will overcome these hurdles by utilizing an ultra-fast optogenetic system that allows for efficient and reversible nuclear depletion of mammalian proteins upon blue light exposure. We will combine this approach with a range of high-resolution genomic tools to investigate the context-specific functions of transcription factors, co-activators, and architectural proteins throughout erythroid differentiation. Importantly, our set-up does not only allow for characterisation of acute protein depletion, but also enables us to map the molecular events triggered by restoration of regulatory proteins to the nucleus. This unique approach will therefore provide detailed insight into their molecular functions. Moreover, to get a more complete overview of the proteins involved in gene activation, we will implement a locus-specific proteomics approach that enables unbiased identification of the proteome of regulatory regions. This innovative integrated research program has strong potential to transform our understanding of the molecular mechanisms that shape the genome and drive gene activation during cellular differentiation. Furthermore, it will lead to the development of cutting-edge tools to analyse gene regulation in its 3D context at high temporal and spatial resolution.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Biomoleküle Proteine Proteomik
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Genom
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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(öffnet in neuem Fenster) ERC-2023-STG
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
80539 MUNCHEN
Deutschland
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.