Descripción del proyecto
Neuroblastoma: hacer diana con más de una bala
El cáncer es una de las principales causas de enfermedad y muerte en el mundo y la incidencia de diferentes tipos de cáncer está aumentando. Un factor clave que contribuye al fracaso de las terapias, la farmacorresistencia y la letalidad del cáncer es la heterogeneidad intratumoral, es decir, la existencia de distintas poblaciones celulares con perfiles moleculares y fenotípicos diferentes en un mismo tumor sólido. El proyecto Precision Lethality, financiado por el Consejo Europeo de Investigación, tiene por objeto aprovechar el código de barras celular —etiquetar células individuales de interés con marcadores genéticos únicos o códigos de barras— y el aprendizaje profundo para hacer frente a este reto. Los nuevos conocimientos deberían ayudar al equipo del proyecto a identificar y verificar nuevas polifarmacoterapias contra el neuroblastoma, el tumor infantil sólido extracraneal más frecuente.
Objetivo
Tumors are heterogeneous in nature due to genetic instabilitTumors are heterogeneous in nature due to genetic instability, ongoing selection, and variable microenvironments with local adaptation. Many tumors thus necessitate combinatorial drug treatments to reach all cells. This is true also for neuroblastoma, the most common extracranial solid pediatric tumor. Despite the well-known importance of clonal heterogeneity, most in vitro drug combination strategies, including commonly used synergistic interaction, do not quantify subclonal drug response. Here recently developed cell barcoding strategies will be used to monitor survival of thousands of individual subclones in neuroblastoma organoids, under different drug perturbations. This lineage tracing strategy allows identification of cell populations that survive a specific drug, and to find other drugs that specifically target those cell populations. I call this strategy Precision Lethality.
In this research program two different precision lethality methodologies will be developed, one where cell barcoding is used to identify drug combinations with low cross-resistance, and one that uses the possibility to express the barcode so it can be captured by single cell RNA sequencing. This allows assessing the transcriptional state before drug perturbation of cells that are known to be either drug resistant or drug sensitive. Combined with publicly available drug sensitivity data repositories, this will be used to construct a deep learning model to predict drug sensitivities of individual cells.
Successful completion of this multi-disciplinary research program will identify and verify new drugs to complement standard of care consolidation therapy for neuroblastoma. I also envision that these studies will showcase to the broader cancer research community how cell barcoding can be used as a drug combination strategy to overcome clonal heterogeneity, which would increase the chances of finding curative cancer treatments.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias médicas y de la salud medicina clínica oncología
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ARN
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2023-STG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
171 77 STOCKHOLM
Suecia
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.