Description du projet
Faire la lumière sur les mécanismes d’évasion des tumeurs
Les recherches menées au fil des ans ont permis de caractériser les mécanismes de surveillance immunitaire contre le cancer, qui impliquent à la fois les lymphocytes T et B. Cependant, les cellules tumorales peuvent encore échapper à la détection immunitaire, ce qui indique clairement que toutes les interactions entre les lymphocytes T et les tumeurs ne déclenche pas une réponse immunitaire. Le projet TouchCancer, financé par le Conseil européen de la recherche, se concentrera sur ces événements non activants et étudiera les interactions individuelles entre les types de cellules immunitaires et tumorales qui se touchent physiquement dans les biopsies. En s’appuyant sur de nouvelles techniques de séquençage in situ, les chercheurs mettront en lumière l’expression des gènes et les changements moléculaires impliqués dans la diaphonie entre le système immunitaire et les tumeurs. Les résultats du projet amélioreront notre compréhension de l’évasion immunitaire des tumeurs, ouvrant la voie à de nouvelles stratégies d’activation immunitaire.
Objectif
Despite the constant surveillance of immune cells, tumour cells can still evade the immune response. Unravelling the interactions of T cells and B cells with tumour cells can shed light on tumour evasion. Extensive research is focused on the mechanisms of activation of an immune response in T cells. However, it is known that detection events, i.e. physical contact between individual surveying T cells and tumour cells, don’t necessarily lead to such activation. Little is known about physical interactions between T cells and tumour cells that do not end in activation. Here I suggest focusing on these detection-without activation events. In these cases, how is the detection information encoded in T cells? i.e. How are T cells and other immune cells affected by the interaction with tumour cells on the molecular level?. My working assumption is that the evading mechanism can be manifested as a physical change in immune cells upon touching tumour cells, and I suggest detecting the ‘smoking gun’ of this process in biopsies, in the form of changes in the gene expression program of touching immune cells. This was not done before because it is almost impossible to study single interacting cells in tumour tissues. It requires both high spatial resolution, to detect individually interacting cells, and high molecular resolution, to quantify cell types and states. Here, using a technology I developed for in situ sequencing with super-resolution, I will generate the first dataset of super-resolved spatial genomics mapping of human biopsies and detect tens of thousands of individual interactions between physically touching immune and tumour cell types. I will then build a new imaging technology to sequence T cell and B cell receptor in situ and detect tumour-specific ones, and will build a computational framework to detect genes and pathways involved in the immune-tumour crosstalk. This will reveal mechanistic insights into tumour evasion and suggest directions for its reversion.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN.
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Programme(s)
- HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC) Main Programme
Thème(s)
Régime de financement
HORIZON-ERC - HORIZON ERC GrantsInstitution d’accueil
52900 Ramat Gan
Israël