Projektbeschreibung
Aufdeckung der Umgehungsmechanismen von Tumoren
Im Laufe der Jahre hat die Forschung die Mechanismen der Immunüberwachung gegen Krebs, an denen sowohl T- als auch B-Zellen beteiligt sind, charakterisiert. Allerdings können sich Tumorzellen immer noch der Erkennung durch das Immunsystem entziehen, was eindeutig darauf hindeutet, dass nicht alle Interaktionen zwischen T-Zellen und Tumor zu einer Immunantwort führen. Das Team des vom Europäischen Forschungsrat finanzierten Projekts TouchCancer wird sich auf diese nicht-aktivierenden Ereignisse konzentrieren und die individuellen Interaktionen zwischen sich physisch berührenden Immun- und Tumorzelltypen in Biopsien untersuchen. Die Forschenden werden mithilfe einer neuartigen Technik der In-situ-Sequenzierung die Genexpression und molekulare Veränderungen aufdecken, die beim Crosstalk zwischen Immunsystem und Tumor eine Rolle spielen. Die Projektergebnisse werden unser Verständnis der Immunumgehung von Tumoren verbessern und den Weg für neue Strategien zur Aktivierung des Immunsystems ebnen.
Ziel
Despite the constant surveillance of immune cells, tumour cells can still evade the immune response. Unravelling the interactions of T cells and B cells with tumour cells can shed light on tumour evasion. Extensive research is focused on the mechanisms of activation of an immune response in T cells. However, it is known that detection events, i.e. physical contact between individual surveying T cells and tumour cells, don’t necessarily lead to such activation. Little is known about physical interactions between T cells and tumour cells that do not end in activation. Here I suggest focusing on these detection-without activation events. In these cases, how is the detection information encoded in T cells? i.e. How are T cells and other immune cells affected by the interaction with tumour cells on the molecular level?. My working assumption is that the evading mechanism can be manifested as a physical change in immune cells upon touching tumour cells, and I suggest detecting the ‘smoking gun’ of this process in biopsies, in the form of changes in the gene expression program of touching immune cells. This was not done before because it is almost impossible to study single interacting cells in tumour tissues. It requires both high spatial resolution, to detect individually interacting cells, and high molecular resolution, to quantify cell types and states. Here, using a technology I developed for in situ sequencing with super-resolution, I will generate the first dataset of super-resolved spatial genomics mapping of human biopsies and detect tens of thousands of individual interactions between physically touching immune and tumour cell types. I will then build a new imaging technology to sequence T cell and B cell receptor in situ and detect tumour-specific ones, and will build a computational framework to detect genes and pathways involved in the immune-tumour crosstalk. This will reveal mechanistic insights into tumour evasion and suggest directions for its reversion.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht.
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Schlüsselbegriffe
Programm/Programme
- HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC) Main Programme
Thema/Themen
Finanzierungsplan
HORIZON-ERC - HORIZON ERC GrantsGastgebende Einrichtung
52900 Ramat Gan
Israel