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CORDIS - Forschungsergebnisse der EU
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Using super-resolved in situ sequencing to reveal the cellular encoding of immune-tumour contact events

Projektbeschreibung

Aufdeckung der Umgehungsmechanismen von Tumoren

Im Laufe der Jahre hat die Forschung die Mechanismen der Immunüberwachung gegen Krebs, an denen sowohl T- als auch B-Zellen beteiligt sind, charakterisiert. Allerdings können sich Tumorzellen immer noch der Erkennung durch das Immunsystem entziehen, was eindeutig darauf hindeutet, dass nicht alle Interaktionen zwischen T-Zellen und Tumor zu einer Immunantwort führen. Das Team des vom Europäischen Forschungsrat finanzierten Projekts TouchCancer wird sich auf diese nicht-aktivierenden Ereignisse konzentrieren und die individuellen Interaktionen zwischen sich physisch berührenden Immun- und Tumorzelltypen in Biopsien untersuchen. Die Forschenden werden mithilfe einer neuartigen Technik der In-situ-Sequenzierung die Genexpression und molekulare Veränderungen aufdecken, die beim Crosstalk zwischen Immunsystem und Tumor eine Rolle spielen. Die Projektergebnisse werden unser Verständnis der Immunumgehung von Tumoren verbessern und den Weg für neue Strategien zur Aktivierung des Immunsystems ebnen.

Ziel

Despite the constant surveillance of immune cells, tumour cells can still evade the immune response. Unravelling the interactions of T cells and B cells with tumour cells can shed light on tumour evasion. Extensive research is focused on the mechanisms of activation of an immune response in T cells. However, it is known that detection events, i.e. physical contact between individual surveying T cells and tumour cells, don’t necessarily lead to such activation. Little is known about physical interactions between T cells and tumour cells that do not end in activation. Here I suggest focusing on these detection-without activation events. In these cases, how is the detection information encoded in T cells? i.e. How are T cells and other immune cells affected by the interaction with tumour cells on the molecular level?. My working assumption is that the evading mechanism can be manifested as a physical change in immune cells upon touching tumour cells, and I suggest detecting the ‘smoking gun’ of this process in biopsies, in the form of changes in the gene expression program of touching immune cells. This was not done before because it is almost impossible to study single interacting cells in tumour tissues. It requires both high spatial resolution, to detect individually interacting cells, and high molecular resolution, to quantify cell types and states. Here, using a technology I developed for in situ sequencing with super-resolution, I will generate the first dataset of super-resolved spatial genomics mapping of human biopsies and detect tens of thousands of individual interactions between physically touching immune and tumour cell types. I will then build a new imaging technology to sequence T cell and B cell receptor in situ and detect tumour-specific ones, and will build a computational framework to detect genes and pathways involved in the immune-tumour crosstalk. This will reveal mechanistic insights into tumour evasion and suggest directions for its reversion.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants

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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) ERC-2023-STG

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Gastgebende Einrichtung

BAR ILAN UNIVERSITY
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 2 124 896,00
Adresse
BAR ILAN UNIVERSITY CAMPUS
52900 Ramat Gan
Israel

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Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

€ 2 124 896,00

Begünstigte (1)

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