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Revealing the wiring rules of neural circuit assembly with spatiotemporally resolved molecular connectomics

Description du projet

Connectomique moléculaire: appréhender la connectivité spécifique aux synapses

Le comportement, les émotions et la cognition sont des phénomènes à grande échelle qui reposent sur le gigantesque nombre de cellules du cerveau et sur le nombre encore plus gigantesque de synapses. Le génome humain joue un rôle clé dans le développement de cette symphonie d’interconnectivité. Appréhender la manière dont l’information génomique conduit à une connectivité spécifique aux synapses exige de comprendre fondamentalement le système nerveux et son développement. Ceci est également essentiel pour comprendre et traiter les dysfonctionnements du système nerveux. Le projet SpaRC, financé par le CER, se propose de développer une approche innovante pour retracer les circuits neuronaux massivement parallèles en s’appuyant sur le virus de la rage à code-barres et le séquençage 3D de l’ARN des tissus intacts. Il permettra de mesurer à grande échelle les mécanismes moléculaires, cellulaires et circulaires, et de faire la lumière sur les réseaux neuronaux du cerveau, en bonne santé ou malades.

Objectif

The human genome contains several thousand genes that play a key role in the development of the brains connectome, a precise assembly of neural connections with billions of neurons and trillions of synapses. How is genomic information translated into synapse-specific connectivity underlying behavior and cognition? Answering this fundamental question will provide important insights about the principles underlying nervous system development and is relevant for neurodevelopmental disorders such as autism. However, current approaches to measure neuronal connectivity have intrinsic limitations that prevent combined analysis of connected neurons, and their gene expression profiles at a scale that matches the complexity of the mammalian nervous system. Here I propose to develop a novel approach for massively parallel neural circuit tracing with barcoded rabies virus and 3D intact-tissue RNA-sequencing. This will permit a comprehensive understanding about neural network architecture via the large-scale measurement of molecular, cellular, and circuit-level mechanisms in the mouse brain. Compared to current efforts that require vast scientific resources to map synaptic connectivity among a few cells or small tissue volumes, my approach will enable routine measurements of connections among thousands of single neurons with molecular detail. Based on my expertise in in vivo barcoding I will conduct a longitudinal study to reveal the wiring rules underlying the spatiotemporal development of neural circuits from diverse neuron types in the mouse prefrontal cortex, a brain region that plays a key role in cognition. I will follow a cross-sectional approach to unravel the effects of distinct mutations on neuronal wiring in the prefrontal cortex in two mouse models of autism (Cntnap2-/-, Syngap1+/-). My work will provide an innovative experimental platform and provide mechanistic insights into the developmental algorithms that the genome uses to encode the connectome.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

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Régime de financement

HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants

Institution d’accueil

KAROLINSKA INSTITUTET
Contribution nette de l'UE
€ 1 500 000,00
Adresse
Nobels Vag 5
17177 Stockholm
Suède

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Région
Östra Sverige Stockholm Stockholms län
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Liens
Coût total
€ 1 500 000,00

Bénéficiaires (2)