Skip to main content
Ir a la página de inicio de la Comisión Europea (se abrirá en una nueva ventana)
español español
CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
CORDIS

Functional cartography of intestinal host-microbiome interactions

Descripción del proyecto

Descifrar las interacciones entre el microbioma intestinal y el hospedador

El microbioma intestinal es una comunidad compleja de microorganismos, entre ellos bacterias, virus y hongos, que residen en el tubo digestivo. Desempeña un papel crucial en la digestión, la función inmunitaria y la salud en general al interactuar con las células del hospedador e influir en los procesos metabólicos. El equipo del proyecto CartoHostBug, financiado por el CEI, pretende delinear las interacciones hospedador-microbioma a nivel celular y molecular. Los investigadores cartografiarán la composición transcripcional y del microbioma en el intestino humano con la esperanza de delinear nichos locales formados por microbios específicos y células hospedadoras. Dado que la desregulación del microbioma intestinal se ha relacionado con diversas enfermedades, como la enfermedad inflamatoria intestinal, el cáncer colorrectal y los trastornos metabólicos, los hallazgos del proyecto pueden ayudar a identificar los biomarcadores de las enfermedades.

Objetivo

Microbiome-host crosstalk is crucial for gut homeostasis and its dysregulation is a hallmark of diseases such as colorectal cancer (CRC) and inflammatory bowel disease (IBD). Despite its key relevance for a holistic understanding of the human superorganism and its (patho-)physiology, how local host-microbiome interactions form specific niches in the gut and how these niches function at the cellular and molecular level remains unexplored, mainly due to a lack of suitable technologies.
To fill this gap, we propose to jointly reconstruct the host transcriptional and microbiome compositional landscape of the human gut across a large number of healthy individuals as well as IBD and CRC patients. For this, we will leverage a combination of novel spatial profiling technologies for unbiased transcriptome sequencing and microbiome profiling at single-cell resolution in situ. First, we will spatially delineate local niches formed of specific microbes and host cells. To dissect this complex crosstalk into specific interactions, we will secondly use in vitro and in vivo models to introduce perturbations either on the host or the microbiome side. Finally, we will integrate the resulting data to deconvolute host-microbiome circuits computationally and to predict functional niches, in particular host responses to pathogens of relevance in IBD and CRC. Interesting predictions will be tested in organoid and animal models. Developing a spatially resolved computational model of the gut ecosystem will allow us to predict early local events in disease onset; from these we will identify and validate prognostic IBD and CRC biomarkers for future clinical translation.

This work will revolutionize our understanding of intestinal host-microbiome interactions by adding a first-ever functionally resolved spatial dimension with clinical relevance for the future diagnosis and treatment of intestinal disorders.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

Para utilizar esta función, debe iniciar sesión o registrarse

Palabras clave

Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).

Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

HORIZON-ERC-SYG - HORIZON ERC Synergy Grants

Ver todos los proyectos financiados en el marco de este régimen de financiación

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2023-SyG

Ver todos los proyectos financiados en el marco de esta convocatoria

Institución de acogida

KAROLINSKA INSTITUTET
Aportación neta de la UEn

Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.

€ 2 827 592,22
Dirección
NOBELS VAG 5
171 77 STOCKHOLM
Suecia

Ver en el mapa

Región
Östra Sverige Stockholm Stockholms län
Tipo de actividad
Higher or Secondary Education Establishments
Enlaces
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

€ 2 827 592,22

Beneficiarios (4)

Mi folleto 0 0