Functional cartography of intestinal host-microbiome interactions

Informations projet

CartoHostBug

N° de convention de subvention: 101118531

DOI

10.3030/101118531

Date de signature de la CE 19 Juin 2024

Date de début 1 Juillet 2024

Date de fin 30 Juin 2030

Financé au titre de

• European Research Council (ERC)

Coût total

€ 10 382 670,00

Contribution de l’UE

€ 10 382 670,00

Coordonné par

KAROLINSKA INSTITUTET
Sweden

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Publications

Peer reviewed articles (7)

Decoding the complexity of intestinal immunity with spatial transcriptomics

Auteurs: Martín Suárez-Álvarez, María A Ulloa, Eduardo J Villablanca
Publié dans: Current Opinion in Immunology, Numéro 101, 2026, ISSN 0952-7915
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.COI.2026.102806

ProbeST: a custom probe design pipeline for dual host–pathogen Spatial Transcriptomics

Auteurs: Sofia Rouot, Ireen van Dolderen, Patrick Rosendahl Andreassen, Solène Frapard, Sybil A. Herrera-Foessel, Hailey Sounart, Sami Saarenpää, Julia A. Vorholt, Stefania Giacomello
Publié dans: BMC Genomics, Numéro 27, 2026, ISSN 1471-2164
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1186/S12864-026-13077-Z

Uncovering Immune Niches in Health and Disease Using Spatial Transcriptomics

Auteurs: Johan Thorsson, Yang Zhao, Eduardo J. Villablanca, Camilla Engblom
Publié dans: European Journal of Immunology, Numéro 56, 2026, ISSN 0014-2980
Éditeur: Wiley
DOI: 10.1002/EJI.70185

Meta-analysis reveals microbiome signatures for colorectal cancer that are universal across age groups and sequencing methods

Auteurs: Selin Pekel, Nicolai Karcher, Morgan Essex, Fabian Springer, Stefano Romano, Quinten R. Ducarmon, Christian Schudoma, Martin Larralde, Alberto Lupatin, Sebastian Zeissig, Michael Zimmermann, Georg Zeller
Publié dans: Cell Host & Microbe, Numéro 34, 2026, ISSN 1931-3128
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.CHOM.2026.05.030

Promoting intestinal regeneration without tumor risk in immune-mediated inflammatory diseases

Auteurs: Angélica Díaz-Basabe, Ning He, Eduardo J. Villablanca
Publié dans: Trends in Immunology, 2026, ISSN 1471-4906
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.IT.2026.05.004

B cells in inflammatory bowel disease

Auteurs: Francisca A. Castillo, Bianca C. Kern, Eduardo J. Villablanca
Publié dans: Immunology Letters, Numéro 277, 2026, ISSN 0165-2478
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.IMLET.2025.107071

Spatiotemporal analysis reveals distinct inflammatory programs underlying chronic colitis

Auteurs: Jennifer Fransson, Chiara Sorini, Francisca Castillo, Yuhao Chi, Ning He, Martin Suarez-Alvarez, Maria Alejandra Ulloa, Rodrigo A. Morales Castro, Ali Okhovat, Hailey Sounart, Chiara Zagami, Rebeca F. Cardoso, Srustidhar Das, Stefania Giacomello, Anna Mechling, Charlotte R.H. Hedin, Philip Smith, Eduardo J. Villablanca
Publié dans: Immunity, Numéro 59, 2026, ISSN 1074-7613
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.IMMUNI.2026.04.005