Functional cartography of intestinal host-microbiome interactions

Projektinformationen

CartoHostBug

ID Finanzhilfevereinbarung: 101118531

DOI

10.3030/101118531

EK-Unterschriftsdatum 19 Juni 2024

Startdatum 1 Juli 2024

Enddatum 30 Juni 2030

Finanziert unter

• European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 10 382 670,00

EU-Beitrag

€ 10 382 670,00

Koordiniert durch

KAROLINSKA INSTITUTET
Sweden

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (7)

Decoding the complexity of intestinal immunity with spatial transcriptomics

Autoren: Martín Suárez-Álvarez, María A Ulloa, Eduardo J Villablanca
Veröffentlicht in: Current Opinion in Immunology, Ausgabe 101, 2026, ISSN 0952-7915
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.COI.2026.102806

ProbeST: a custom probe design pipeline for dual host–pathogen Spatial Transcriptomics

Autoren: Sofia Rouot, Ireen van Dolderen, Patrick Rosendahl Andreassen, Solène Frapard, Sybil A. Herrera-Foessel, Hailey Sounart, Sami Saarenpää, Julia A. Vorholt, Stefania Giacomello
Veröffentlicht in: BMC Genomics, Ausgabe 27, 2026, ISSN 1471-2164
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1186/S12864-026-13077-Z

Uncovering Immune Niches in Health and Disease Using Spatial Transcriptomics

Autoren: Johan Thorsson, Yang Zhao, Eduardo J. Villablanca, Camilla Engblom
Veröffentlicht in: European Journal of Immunology, Ausgabe 56, 2026, ISSN 0014-2980
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.1002/EJI.70185

Meta-analysis reveals microbiome signatures for colorectal cancer that are universal across age groups and sequencing methods

Autoren: Selin Pekel, Nicolai Karcher, Morgan Essex, Fabian Springer, Stefano Romano, Quinten R. Ducarmon, Christian Schudoma, Martin Larralde, Alberto Lupatin, Sebastian Zeissig, Michael Zimmermann, Georg Zeller
Veröffentlicht in: Cell Host & Microbe, Ausgabe 34, 2026, ISSN 1931-3128
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.CHOM.2026.05.030

Promoting intestinal regeneration without tumor risk in immune-mediated inflammatory diseases

Autoren: Angélica Díaz-Basabe, Ning He, Eduardo J. Villablanca
Veröffentlicht in: Trends in Immunology, 2026, ISSN 1471-4906
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.IT.2026.05.004

B cells in inflammatory bowel disease

Autoren: Francisca A. Castillo, Bianca C. Kern, Eduardo J. Villablanca
Veröffentlicht in: Immunology Letters, Ausgabe 277, 2026, ISSN 0165-2478
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.IMLET.2025.107071

Spatiotemporal analysis reveals distinct inflammatory programs underlying chronic colitis

Autoren: Jennifer Fransson, Chiara Sorini, Francisca Castillo, Yuhao Chi, Ning He, Martin Suarez-Alvarez, Maria Alejandra Ulloa, Rodrigo A. Morales Castro, Ali Okhovat, Hailey Sounart, Chiara Zagami, Rebeca F. Cardoso, Srustidhar Das, Stefania Giacomello, Anna Mechling, Charlotte R.H. Hedin, Philip Smith, Eduardo J. Villablanca
Veröffentlicht in: Immunity, Ausgabe 59, 2026, ISSN 1074-7613
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.IMMUNI.2026.04.005