Objetivo
The physical organization of bacterial chromosomes is inherently variable, with large conformational fluctuations both from cell to cell and over time. Yet, chromosomes must also be structured to facilitate processes such as transcription, replication, and segregation. A physical description of this dynamic statistical folding of bacterial chromosomes remains largely elusive.
Hi-C experiments probe chromosome organization by measuring average contact frequencies of chromosomal loci pairs. Despite the rapidly expanding database of high-resolution Hi-C data for many bacterial species and conditions, these data are still mainly interpreted on a case-by-case basis and with qualitative or heuristic methods.
My goal is to develop a principled unifying approach to infer and analyze the dynamic organization of chromosomes from bacterial Hi-C data. This data-driven approach aims to unravel the dynamic statistical folding of chromosomes and its impact on functional processes in growing and replicating bacteria.
We will infer a bacterial chromosome model from state-of-the-art data using learning methods at the intersection of information theory and statistical mechanics. By combining data-driven with mechanistic modelling approaches, we aim to:
Decode information contained in Hi-C data by learning both 3D steady-state and 4D dynamic models for the statistical organization of chromosomes.
Provide a unifying statistical mechanics analysis of the dynamic statistical folding of chromosomes across bacterial species under both steady-state and replicating conditions.
Develop theoretical methods using pairwise and multi-contact statistics to study the topology of statistical chromosome folding.
My research will advance the field by providing a conceptual understanding of the physical and mechanistic principles that underlie chromosome organization in developing bacteria. This work could shed new light on vital functional processes such as chromosome segregation.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales informática y ciencias de la información base de datos
- ciencias naturales ciencias biológicas microbiología bacteriología
- ciencias naturales matemáticas matemáticas puras topología
- ciencias naturales ciencias físicas mecánica clásica mecánica estadística
- ciencias naturales ciencias biológicas genética cromosoma
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
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Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
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(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2023-COG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
1081 HV Amsterdam
Países Bajos
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.