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Functional evolution of giant virus capsids

Description du projet

Le rôle de virus géants présentant des modifications inédites de la capside dans l’adaptation

La plupart des virus possèdent des gènes qui assurent leur réplication et la production de leur capside. Le premier virus «géant» a été découvert en 2003. Son génome codait près d’un millier de protéines et il était observable au microscope optique. De nombreuses autres souches de virus géants ont depuis lors été découvertes. Bien qu’ils aient beaucoup appris sur leur diversité génétique, les scientifiques en savent encore peu sur la structure de leur capside et sur leurs mécanismes d’infection. Le projet CAPSOLUTION, financé par le CER, se propose de caractériser les modifications de la capside de deux virus géants récemment découverts, à l’aide d’études structure-fonction des systèmes virus-hôte et d’analyses évolutives des gènes associés à l’appendice des virus. Il mettra en lumière le rôle des modifications de la capside dans l’adaptation à l’environnement.

Objectif

How do viruses identify their hosts in a challenging environment? This question is highly relevant for protist-infecting giant viruses in aquatic ecosystems, where the density of host cells is typically low and random encounters are rare. Giant viruses have genome sizes of up to two megabases and encode a vast genetic diversity, but we know almost nothing about their diverse capsid structures and the various strategies they use for infecting the next host cell. During the last decade, I have shed light on the symbiotic interactions between marine flagellates, giant viruses and their virophage parasites.
With CAPSOLUTION, I will use our collection of freshwater flagellate cultures to characterize giant viruses with previously unknown capsid structures from oligotrophic lakes. We recently discovered two giant viruses with unprecedented capsid modifications: “Cometa virus”, whose capsid has a bundle of unique head fibers and a conical tail; and “Sentinel virus”, whose tentacle-like appendages span several micrometers. CAPSOLUTION will allow me to characterize the fascinating virion structures of Cometa and Sentinel viruses at molecular resolution and elucidate their function during host attachment and infection.
What is the protein composition of these appendages and how are they assembled? How did they evolve? How common and diverse are modified capsids among giant viruses and how do they adapt to environmental constraints? I will address these questions in a multi-disciplinary approach combining the morpho-genomic characterization of natural giant virus communities with structure-function studies of newly isolated virus-host systems and evolutionary analyses of their appendage-associated genes. CAPSOLUTION will reveal how giant viruses use unique capsid modifications to adapt to their environment, thereby breaking new ground in microbiology and expanding our horizon of virus functioning in freshwater lakes.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

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Régime de financement

HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants

Institution d’accueil

MAX-PLANCK-GESELLSCHAFT ZUR FORDERUNG DER WISSENSCHAFTEN EV
Contribution nette de l'UE
€ 2 425 000,00
Coût total
€ 2 425 000,00

Bénéficiaires (1)