Opis projektu
Gigantyczne wirusy z niespotykanymi modyfikacjami kapsydu: ich rola w adaptacji
Większość wirusów ma kilka genów, które wspomagają ich replikację i produkcję kapsydu. Pierwszy „gigantyczny” wirus został odkryty w 2003 roku. Jego genom kodował niemal tysiąc białek i był widoczny pod mikroskopem optycznym. Od tego czasu odkryto wiele innych szczepów gigantycznych wirusów. Pomimo odkrywania nowych informacji na temat ich różnorodności genetycznej, naukowcy wciąż niewiele wiedzą o ich strukturach kapsydu i mechanizmach infekcji. Finansowany przez ERBN projekt CAPSOLUTION ma na celu scharakteryzowanie bezprecedensowych modyfikacji kapsydu dwóch niedawno odkrytych gigantycznych wirusów przy użyciu badań struktury i funkcji systemów wirus-gospodarz oraz analiz ewolucyjnych genów związanych z przydatkami wirusów. Pozwoli to lepiej zrozumieć rolę modyfikacji kapsydu w adaptacji do środowiska.
Cel
How do viruses identify their hosts in a challenging environment? This question is highly relevant for protist-infecting giant viruses in aquatic ecosystems, where the density of host cells is typically low and random encounters are rare. Giant viruses have genome sizes of up to two megabases and encode a vast genetic diversity, but we know almost nothing about their diverse capsid structures and the various strategies they use for infecting the next host cell. During the last decade, I have shed light on the symbiotic interactions between marine flagellates, giant viruses and their virophage parasites.
With CAPSOLUTION, I will use our collection of freshwater flagellate cultures to characterize giant viruses with previously unknown capsid structures from oligotrophic lakes. We recently discovered two giant viruses with unprecedented capsid modifications: “Cometa virus”, whose capsid has a bundle of unique head fibers and a conical tail; and “Sentinel virus”, whose tentacle-like appendages span several micrometers. CAPSOLUTION will allow me to characterize the fascinating virion structures of Cometa and Sentinel viruses at molecular resolution and elucidate their function during host attachment and infection.
What is the protein composition of these appendages and how are they assembled? How did they evolve? How common and diverse are modified capsids among giant viruses and how do they adapt to environmental constraints? I will address these questions in a multi-disciplinary approach combining the morpho-genomic characterization of natural giant virus communities with structure-function studies of newly isolated virus-host systems and evolutionary analyses of their appendage-associated genes. CAPSOLUTION will reveal how giant viruses use unique capsid modifications to adapt to their environment, thereby breaking new ground in microbiology and expanding our horizon of virus functioning in freshwater lakes.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
- inżynieria i technologiainżynieria materiałowawłókna
- nauki przyrodniczenauki biologicznemikrobiologiawirusologia
- nauki przyrodniczenauki biologicznebiochemiabiocząsteczkibiałka
- nauki przyrodniczenauki biologiczneekologiaekosystemy
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Program(-y)
- HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC) Main Programme
Temat(-y)
System finansowania
HORIZON-ERC - HORIZON ERC GrantsInstytucja przyjmująca
80539 Munchen
Niemcy