Descripción del proyecto
Entender la evolución del cáncer
El desarrollo neoplásico implica una serie de mutaciones y cambios epigenéticos en los genes impulsores. Sin embargo, estudiar la evolución del cáncer es un desafío debido a la dificultad de investigar los acontecimientos premalignos. Financiado por el Consejo Europeo de Investigación, el equipo del proyecto Transformation pretende resolver cómo evolucionan los genomas del cáncer humano hacia la malignidad y qué desencadena este proceso. Para ello, los investigadores generarán modelos organoides únicos a partir de cánceres de colon en fase temprana para estudiar los cambios en el genoma, incluidas las mutaciones y las alteraciones cromosómicas. Además, examinar el papel del entorno permitirá comprender mejor la evolución del cáncer y el paso de los adenomas benignos a cánceres malignos.
Objetivo
A crucial milestone in tumor progression is the transformation from a benign adenoma to a malignant cancer, which has profound impact on clinical outcome and therapy design. Despite its importance, it is poorly understood why it manifests itself as a bottleneck that can restrain precancerous adenomas for years. While recent sequencing efforts inform static insights into the status of cancer genomes, these are incomplete to infer how they evolved, assess functional consequence of mutations, nor how much malignancy is environmentally instructed.
Practical limitations hamper scientific advancement into the dynamic nature of tumor evolution. Foremost, studying human tumor evolution is challenging as sequential sampling is not feasible, and pre-malignant events that may hold the clue for understanding transformation often occur years before cancer diagnosis. Moreover, experimental models that reflect malignant transformation, let alone of human origin, are lacking.
TRANSFORMATION aims to resolve how human cancer genomes evolve towards malignancy, and its role in triggering malignancy.
To gain new insights on this matter, TRANSFORMATION takes a unique approach to produce experimental insights into evolutionary parameters that are inherently dynamic in nature and cannot be obtained from tumor sequencing alone. Using paired biopsies from early-stage colon cancers, I generated unique organoid models from pre- and post-transformation regions. Together with in situ analysis of matched tumors, TRANSFORMATION will reveal the elusive rate and order by which mutations and copy-number alterations are acquired, the patterns by which cancer karyotypes evolve, dissecting functional from non-functional genetic heterogeneity on tumor phenotypes and investigate possible selection pressures imposed by environmental conditions.
TRANSFORMATION will solve how colon tumors evolve pre-malignancy, which properties promote malignancy and why transformation is an evolutionary bottleneck.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural.
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- ciencias naturalesciencias biológicasgenéticamutación
- ciencias médicas y de la saludmedicina clínicaoncología
- ciencias naturalesciencias biológicasgenéticagenoma
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Palabras clave
Programa(s)
- HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC) Main Programme
Régimen de financiación
HORIZON-ERC - HORIZON ERC GrantsInstitución de acogida
3584 CX Utrecht
Países Bajos