Descripción del proyecto
Entender cómo influyen las mutaciones en la evolución de la regulación génica
Los sistemas vivos destacan por su capacidad de adaptación a los cambios ambientales. Tanto si se trata de una célula cancerosa que aprende a eludir la quimioterapia como de un microbio que mantiene su función en condiciones cambiantes, el secreto reside a menudo en la regulación de los genes. Cuando las células se enfrentan a cambios ambientales y genéticos, las reglas específicas de «recableado» que permiten que ciertos circuitos genéticos permanezcan estables, mientras otros varían, siguen siendo un misterio. El equipo del proyecto eGRIDE, financiado por el Consejo Europeo de Investigación, pretende descifrar esta evolución reguladora utilizando la levadura «Saccharomyces cerevisiae» como laboratorio viviente. Mediante el análisis de los transcriptomas (conjuntos completos de moléculas de ARN expresadas por las células) de miles de genotipos, en el proyecto se revelará cómo las mutaciones aleatorias pueden remodelar la lógica interna de una célula. Esto proporcionará un modelo para predecir las adaptaciones genéticas a entornos dinámicos.
Objetivo
Living systems are the product of evolution in a dynamically changing world; they endlessly adapt to new challenges imposed by their environment. Yet, our understanding of evolutionary mechanisms involved in adaptation to dynamic environments is very sparse. Even though gene regulation is well-known to endow cells with the ability to adjust their phenotype according to environmental fluctuations, we know little about genetic changes that fuel regulatory evolution or about the benefits and costs of regulatory changes. This lack of knowledge impacts several fields in biology: from the biomedical challenge of cancer plasticity where evolved gene regulations allow cancer cells to escape treatment, to the challenge of synthetic biology where gene circuits must be controlled despite environmental fluctuations.
This project builds on genomic advances to determine how the evolution of gene regulation depends on 1) mutational effects – “what can happen?”, and 2) the selective advantage of regulatory changes in dynamic environments – “who can survive?”. These fundamental questions will be addressed at the transcriptomic scale by combining innovative experimental and computational approaches in a powerful model organism: the yeast Saccharomyces cerevisiae.
Using a novel high-throughput method by which the transcriptomes of thousands of genotypes can be profiled in different environments, we will determine how random mutations potentiate or constrain regulatory evolution and we will identify genetic variants altering gene regulation. By competing random mutants and performing functional assays under diverse regimes of selection, we will determine when and for which genes the evolution of expression regulation is beneficial.
This work will advance our understanding of the genetic mechanisms underlying regulatory differences and of their adaptive value in dynamic environments, providing an empirical foundation for the development of predictive models of regulatory evolution.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ARN transcriptomas
- ciencias naturales ciencias biológicas genética mutación
- ciencias médicas y de la salud medicina clínica oncología
- ingeniería y tecnología ingeniería ambiental energía y combustibles
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2023-COG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
75794 PARIS
Francia
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.