Objectif
Phages have the potential to be used in therapy because they can infect and kill pathogenic bacteria, including those resistant to antibiotics. Although phages are simple, details of their life cycle remain unknown. To start the infection, phages bind to and eject their genome into bacteria. During adsorption, the phage baseplate recognises receptors in the bacterial cell wall, and therefore determines the phage specificity. Structural knowledge of baseplates will enable the rational engineering of phage host range. Before ejection, the phage genome is stored inside the capsid under high pressure. Although numerous studies of genome ejection have been performed, the understanding of this process is still incomplete because, until now, no suitable methods for studying in vivo ejection existed. The adsorption and genome ejection are closely related processes that can only be best understood together.
In this project, hosted at Dr Plevka’s laboratory (CEITEC), I aim to determine the high-resolution structure of the phiKZ baseplate, one of the largest known bacteriophages, using cryogenic Transmission Electron Microscopy. The obtained structural information will be complemented by the characterisation of the genome ejection dynamics in vivo. For this purpose, I will use cryogenic Scanning Transmission Electron Microscopy to quantify the amount of DNA in phage heads at various stages of the infection. Furthermore, I will also use holotomography to visualise the ejection dynamics.
There is still much to discover regarding bacterial adsorption and genome delivery. Thanks to my experience in phage and structural biology, I will integrate this project's results to shed light on the first steps of the phage life cycle, key to the infection of bacteria. My results will expand the understanding of phage infection and enable the retargeting of phages to specific bacterial strains, helping to develop phage therapy since antibiotic resistance is a rising health problem worldwide.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie bactériologie
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie virologie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences physiques optique microscopie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.4.1 - Widening participation and spreading excellence
PROGRAMME PRINCIPAL
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HORIZON.4.1.5 - Fostering brain circulation of researchers and excellence initiatives
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-WIDERA-2022-TALENTS-04
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
601 77 Brno
Tchéquie
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.