Projektbeschreibung
Zuverlässiger, kostengünstiger und hochempfindlicher Nachweis modifizierter Histone
Histone sind Proteine, die sich an die DNS (Chromosomen) im Zellkern anlagern und dazu beitragen, diese zu verpacken und zu organisieren. Einmal im Zytoplasma angekommen, sind posttranslationale Modifikationen an Histonen für viele zelluläre Prozesse wie Transkription und DNS-Reparatur unerlässlich. Das Verständnis der posttranslationale Modifikationen an Histonen ist wichtig für die Vorbeugung und Behandlung von Erkrankungen, einschließlich Krebs. Die Massenspektrometrie, die sich auf einen teuren Anreicherungsschritt stützt, dem es an Reproduzierbarkeit mangelt, wird üblicherweise zur Identifizierung der posttranslationale Modifikationen an Histonen im gesamten Proteom verwendet. Ziel des über die Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen unterstützten Projekts ENRICH ist es, funktionalisierte Nanopartikel zur Anreicherung von Peptiden mit posttranslationalen Modifikationen, die durch proteolytischen Verdau gewonnen wurden, für die anschließende Analyse per Massenspektrometrie zu verwenden, um die derzeitigen Einschränkungen zu überwinden.
Ziel
Scientific studies indicate that inefficient epigenetic control is associated with a wide variety of non-communicable diseases (NCDs) like cancer, schizophrenia, and diabetes. Indeed, histone post translational modifications (PTMs) are crucial for many cellular processes including transcription and DNA repair. Thus, the ability to readily and reliably detect PTMs is crucial to better understand epigenetic processes and the complex functions of histone PTMs in human diseases. Mass spectrometry (MS) is the technique of choice to identify such modifications across the proteome. MS requires an enrichment step generally performed using antibodies, but these have several limitations such as high costs, batch-to-batch variability and data reproducibility. In a multidisciplinary effort ENRICH aims at developing new cost-effective, fast and efficient tools for the enrichment of post translationally modified proteins overcoming the current limitation. ENRICH will functionalize nanoparticles (NPs) with molecular receptors able to enrich PTM-containing peptides, derived from proteolytic digestion, for subsequent MS analysis. Concurrently, the ability and selectivity of the synthesized receptors and functionalized NPs will be evaluated via spectroscopic analyses. The ENRICH network gathers the expertise required to tackle this challenge. The consortium is composed of 9 high-level academic research groups from 2 different continents (Europe and America) and 2 highly innovative companies. By the seconding of 87 ERs/ERSs across Europe and worldwide, the aim is to capitalize on the consortium expertise in complementary fields such as chemical synthesis, spectroscopy, and proteomics. The network promotes an effective integrate training of researchers, boosting their career development, and promotes collaborations between the partners. The direct involvement of industries guarantees the timely exploitation of the results from research laboratories to innovative products.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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Schlüsselbegriffe
Programm/Programme
- HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA) Main Programme
Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2022-SE-01
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43121 PARMA
Italien