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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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Deep genetics to study and uncover ‘hidden’ biology

Descripción del proyecto

Redes génicas, regulación del nivel de aminoácidos y rutas celulares «ocultas»

En los últimos años, nuevas herramientas han posibilitado conocer mejor grandes grupos de genes que trabajan juntos. No obstante, estas no proporcionan información sobre la regulación génica a nivel de dominios proteicos o de aminoácidos individuales. Además, el estado de la célula o la interferencia de otros genes pueden «enmascarar» rutas y procesos celulares importantes. En el proyecto DeepGenetics, financiado por el Consejo Europeo de Investigación, se pretende arrojar luz sobre las redes génicas y la regulación de fenotipos celulares a nivel de aminoácido. La investigación incluirá un estudio exhaustivo a nivel genético de la regulación de fenotipos celulares, la identificación de genes «enmascaradores» y la revelación de sus procesos enmascarados. También se correlacionarán los fenotipos con dominios proteicos funcionales y, en último término, con aminoácidos.

Objetivo

Human genes are organized in complex networks, to produce thousands of proteins to perform a myriad of functions. Whereas we have detailed maps for most biochemical pathways, the wiring of genetic networks in human cells is poorly understood.

Development of powerful human genetic tools (CRISPR, RNAi, haploid cells), to which I made crucial contributions, have proven invaluable to study genetic networks. However, they face two major limitations. First, they provide information at the gene level, whereas it will be much more informative to understand genetic regulation at the level of protein domains or individual amino acids. Second, important biology can be masked – for example, by the cell state or interfering activity of other genes.

With DeepGenetics we will bring our understanding of the genetic regulation of cellular phenotypes to the next level and mine ‘hidden biology’ that even impacts on well-studied cellular traits. We will (i) counterbalance the use of loss-of-function and gain-of-function genetics to obtain a solid gene-level inventory on the regulation of cellular phenotypes; (ii) identify genes that ‘mask’ unknown biology and use modifier screens to expose and define these processes – as we have recently exemplified in my group leading to the discovery of important new cellular pathways, and (iii) connect phenotypes to the functional protein domains and ultimately to the amino acid level.

Thus, DeepGenetics will provide precise views on the regulation of key cellular phenotypes at the amino acid level and will cross the boundaries of our knowledge by exposing ‘hidden biology’.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants

Ver todos los proyectos financiados en el marco de este régimen de financiación

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2023-ADG

Ver todos los proyectos financiados en el marco de esta convocatoria

Institución de acogida

STICHTING HET NEDERLANDS KANKER INSTITUUT-ANTONI VAN LEEUWENHOEK ZIEKENHUIS
Aportación neta de la UEn

Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.

€ 2 451 625,00
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

€ 2 451 625,00

Beneficiarios (1)

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