Description du projet
Réseaux génétiques, régulation des niveaux d’acides aminés et voies cellulaires «cachées»
De nouveaux outils ont récemment permis de mieux comprendre le fonctionnement conjoint de grands groupes de gènes. Ils ne permettent toutefois pas de comprendre la régulation génétique au niveau des domaines protéiques ou des acides aminés individuels. Qui plus est, des voies et processus cellulaires importants peuvent être «masqués» par l’état de la cellule ou l’interférence d’autres gènes. Le projet DeepGenetics, financé par le CER, entend apporter un nouvel éclairage sur les réseaux de gènes et la régulation des phénotypes cellulaires au niveau des acides aminés. Son travail consistera notamment à réaliser une étude complète, au niveau du gène, de la régulation des phénotypes cellulaires, à identifier les gènes «masquants» et à révéler leurs processus masqués. Il reliera également les phénotypes aux domaines protéiques fonctionnels et, en fin de compte, aux acides aminés.
Objectif
Human genes are organized in complex networks, to produce thousands of proteins to perform a myriad of functions. Whereas we have detailed maps for most biochemical pathways, the wiring of genetic networks in human cells is poorly understood.
Development of powerful human genetic tools (CRISPR, RNAi, haploid cells), to which I made crucial contributions, have proven invaluable to study genetic networks. However, they face two major limitations. First, they provide information at the gene level, whereas it will be much more informative to understand genetic regulation at the level of protein domains or individual amino acids. Second, important biology can be masked – for example, by the cell state or interfering activity of other genes.
With DeepGenetics we will bring our understanding of the genetic regulation of cellular phenotypes to the next level and mine ‘hidden biology’ that even impacts on well-studied cellular traits. We will (i) counterbalance the use of loss-of-function and gain-of-function genetics to obtain a solid gene-level inventory on the regulation of cellular phenotypes; (ii) identify genes that ‘mask’ unknown biology and use modifier screens to expose and define these processes – as we have recently exemplified in my group leading to the discovery of important new cellular pathways, and (iii) connect phenotypes to the functional protein domains and ultimately to the amino acid level.
Thus, DeepGenetics will provide precise views on the regulation of key cellular phenotypes at the amino acid level and will cross the boundaries of our knowledge by exposing ‘hidden biology’.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2023-ADG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
1066 CX AMSTERDAM
Pays-Bas
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.